什么是蛋白質的翻譯后修飾?蛋白質的翻譯后修飾(post-translational-modification-analysis.html)是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。通過向修飾基團添加一個或多個氨基酸殘基或通過蛋白質水解切割該基團來改變蛋白質的性質,是蛋白質生物學功能表達的重要步驟。生物蛋白質的翻譯后修飾極大地增加了蛋白質結構的類型和功能。這個過程調節(jié)細胞周期和蛋白質轉錄,并影響表觀遺傳學。蛋白質磷酸化修飾組學具有全方面性。泛素化修飾蛋白質組學分析價格乙?;揎椀鞍踪|組學分析:乙?;揎椀鞍踪|組學分析...
蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,...
蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫(yī)學中的應用:盡管目前大數(shù)據(jù)的獲得會采用基因組學和轉錄組學,但是關鍵的發(fā)現(xiàn)還是依賴蛋白質組數(shù)據(jù)而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫(yī)學具有極大的實用性和普適性,蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾(post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化,研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾(磷酸化、泛素化、?;⒓谆?、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位點,還可以發(fā)現(xiàn)生物標記物及探索藥物/化學調節(jié)物的作用機制。蛋白質的翻譯后修飾調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。四川蛋...
蛋白質修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性,從而檢測蛋白質或者多肽上位點發(fā)生何種修飾。可檢測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;?、丁?;⒈;⑽於;?、琥珀酰化、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質折疊、更新以及免疫應答等;3、乙?;夯虮磉_調控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA修復以及信號轉導等;5、甲基化:染色質結構及轉錄調控等;6、丙酰化 / 丙二?;?/ 戊二酰化 / 琥珀?;褐饕嬖谟?..
乙?;揎椀鞍踪|組學分析:乙?;揎椀鞍踪|組學分析是指從蛋白質組學的水平分析蛋白質乙?;揎棧ㄒ阴;鞍踪|的鑒定和定量。提供基于質譜的乙?;鞍捉M研究服務。蛋白質乙?;ńM蛋白乙?;头墙M蛋白乙酰化。組蛋白乙酰化主要是賴氨酸乙?;?,已在基因轉錄調控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙酰化構成了哺乳動物細胞中乙?;鞍椎闹饕糠?,參與了所有主要生物過程,包括蛋白質的定位、轉移、功能和降解,遺傳物質的轉錄和復制等。除了重要的生物學功能以外,乙?;鞍踪|及其調控酶還與衰老和多種疾?。ㄈ缟窠?jīng)變形紊亂、心血管疾病等)緊密相關。因此,對乙酰化修飾蛋白質組進行研究有助于進一步探索細胞的生命活動與了解相關疾...
蛋白質修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性,從而檢測蛋白質或者多肽上位點發(fā)生何種修飾??蓹z測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;⒍□;⒈;?、戊二?;?、琥珀?;?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質折疊、更新以及免疫應答等;3、乙酰化:基因表達調控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA修復以及信號轉導等;5、甲基化:染色質結構及轉錄調控等;6、丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二?;?/ 琥珀酰化:主要存在于...
翻譯后修飾蛋白組學分析:蛋白質組學的研究的工作不只聚焦于細胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質表達水平變化,許多至關重要的生命進程不只由蛋白質相對豐度控制,更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調控,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質復雜多樣的生物功能的一個重要前提。蛋白質發(fā)生翻譯后修飾時其分子質量會發(fā)生響應的改變,通過質譜能夠精確測定蛋白質或多肽的分子質量。同時,發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質再樣本中含量低且動態(tài)范圍廣,所以在質譜檢測前需要對發(fā)生修飾的蛋白質或肽段進行富集。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。棕櫚?;揎椀鞍踪|組學技術服務蛋白質磷酸化修飾組學:蛋白質的磷酸化修飾...
蛋白質磷酸化修飾組學技術優(yōu)點:1、全方面性:磷酸化蛋白質組學以整個細胞蛋白為研究對象,研究內容包括了細胞內具有生命功能的蛋白,如細胞增生、細胞分裂和細胞分化等相關蛋白,因而研究更為全方面。2、可靠性:傳統(tǒng)的生物學研究蛋白質磷酸化往往針對特定條件,以兩個蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發(fā)點,具有局限性,缺乏整體認識。磷酸化蛋白質組學則可檢測不同蛋白激酶及磷酸化酶對同一個蛋白磷酸化程度的影響,因而結果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白質組學反映的是細胞內真實發(fā)生的事件,在一次試驗中考慮了不同變量,克服了生物學中逐步添加變量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白質組學以細胞內蛋白為研究對象,相對于傳...
蛋白質有哪些翻譯后修飾?作用機制和生物學功能是什么?前體蛋白是沒有活性的,常常要進行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學修飾和剪切。當合成蛋白質時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質。蛋白質的翻譯后蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)會附在蛋白質上從而改變蛋白質的化學性質,或是造成結構的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質的功能。再者,酶可以從蛋白質的N末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,...
蛋白質乙酰化修飾定義:蛋白質在細胞中經(jīng)過翻譯后,到被運輸?shù)较鄳募毎鞑⑶野l(fā)生特定的生物學作用前會經(jīng)過很重要的一步加工,那就是蛋白質翻譯后修飾加工。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性、定位或功能。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。常見的蛋白質翻譯后修飾包括磷酸化,乙酰化,糖基化,泛素化等。蛋白質乙?;揎?,顧名思義指的就是在蛋白質原有基礎上面嫁接上乙?;鶊F。在細胞中,乙?;揎椀姆磻梢阴;D移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙酰基轉移并添加在蛋白質賴氨酸殘基上。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾,直到后來研究發(fā)現(xiàn)原...
蛋白質糖基化修飾組學技術:糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,它們與糖鏈可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然...
蛋白質乙?;揎椊M學技術:乙?;揎検求w內保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?;碾亩危瑥亩鴮崿F(xiàn)乙?;蔫b定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)?;旌系鞍踪|):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。蛋白質翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。貴陽丙?;揎椀鞍踪|組學分析價格蛋白質翻譯后...
蛋白質糖基化修飾組學技術:糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,它們與糖鏈可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然...
質譜分析乙酰化蛋白質組:質譜分析技術可以對蛋白質組中的乙?;鞍走M行鑒定、乙?;稽c定位以及定量。當質譜用于乙?;康鞍捉M研究中時,因為乙?;鞍踪|在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,需要先對乙?;亩芜M行富集,然后再對富集得到的乙酰化肽段樣品進行定量分析。質譜定量乙?;鞍捉M采用肽段預分離降低高豐度蛋白的影響,結合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩危瑥亩鴮崿F(xiàn)大規(guī)模乙?;蔫b定及定量。為了鑒定和定量更多的乙酰化肽段,在酶切過程中還可使用多種不同的酶對蛋白樣品進行酶切。蛋白質翻譯后修飾可以改變蛋白質的物理、化學性質。廣東蛋白質泛素化修飾組學蛋白質乙酰化修飾組學技術:乙?;揎検求w內高度保守的...
蛋白質翻譯后修飾組學:血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質上的過程,是一種常見的蛋白質翻譯后修飾。分泌的細胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質包括維持機體正常生理狀態(tài)的蛋白質和機體分泌、滲漏、脫落的蛋白質,其中不乏存在一些糖基化蛋白質。而蛋白質糖基化修飾不只影響蛋白質的空間構象、生物活性、運輸和定位,而且在分子識別、細胞通信、信號轉導等特定生物過程中發(fā)揮著至關重要的作用。因此對血漿蛋白糖基化進行分析,有助于研究血漿蛋白的生理功能等。乙?;揎検窃撕驼婧松锼灿械囊环N翻譯后修飾類型。湖北蛋白質丙?;揎椊M學費...
蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。深圳氧化修飾蛋白質組學質譜分析蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化,將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪...
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節(jié)整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質對揭示蛋白質的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。因此,要在蛋白質組學的范圍內表征翻譯后修飾蛋白,純化方法是必要的,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質譜技術進行,可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性。山東蛋白質丙二?;揎椊M學質譜鑒定蛋白質翻譯后修飾組學:蛋白質翻譯后修飾(Post-tra...
質譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析;通過質譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。乙酰...
蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎生物學以及疾病發(fā)病機理中的重要性,因此非常需要對蛋白質的翻譯后修飾進行檢測。對蛋白翻譯后修飾進行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結合在一起開發(fā),以提供比較好的機會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質時,可能不需要富集步驟。質譜技術,通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進行定性和定量分析。蛋白質翻譯后修飾可以改變蛋白質的物理、化學性質。浙江琥珀?;揎椀鞍踪|組學主要方式質譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于...
蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術有:a. 凝集素親和技術;b. 肼化學富集;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應?;谫|譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記,泛素用親和標簽(通常為6xHis)進行標記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構,經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gl...
蛋白質修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性,從而檢測蛋白質或者多肽上位點發(fā)生何種修飾??蓹z測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;?、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質折疊、更新以及免疫應答等;3、乙?;夯虮磉_調控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA修復以及信號轉導等;5、甲基化:染色質結構及轉錄調控等;6、丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二?;?/ 琥珀?;褐饕嬖谟?..
蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術:技術優(yōu)勢特點。1、 檢測特異性高。2、能夠特異鑒定單個磷酸化位點。同位素標記(Isotope Labeled)結合免疫印跡法:此方法的原理是當?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時,放射性32P的摻入和分子質量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過免疫印跡方法檢測同位素標記,從而達到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術優(yōu)勢特點:1、檢測技術靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應結果檢測。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時分析多個蛋白磷酸化。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。蛋白質糖基化修飾組學分析研究翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節(jié)整個細胞過程...
蛋白質乙?;揎椊M學技術:乙酰化修飾是體內高度保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著非常重要的作用。此外,還存在大量的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。乙?;揎椊M學技術服務采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩?,從而實現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。蛋白質泛素化修飾組學技術:泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位,調控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細...
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術對蛋白質的有效分辨率已達到229...
蛋白質翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質表達水平的變化。然而,許多生命過程不只受蛋白質的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質復雜性和多樣的生物學功能的前提。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質含量低、動態(tài)范圍廣給相關研究帶來了很大的挑戰(zhàn)?;诜g后修飾蛋白的異質性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質譜和生物信息學工具對其進行研究。用于PTM分析的質譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質鑒定的方法,包括...
蛋白質翻譯后修飾的檢測方法:質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一,可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs),如磷酸化、乙?;?、泛素化、SUMO化、糖基化等,大幅度的增加了蛋白質組的復雜性。檢測蛋白質的翻譯后修飾,了解它們如何工作、影響蛋白質組和調控基因組將極大地提高我們對遺傳學和表觀遺傳學的理解。目標蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟,因為修飾蛋白的豐度一般較低。大多數(shù)PTMs檢測方法都是結合富集策略開發(fā)的,以比較好的識別、驗證和研究目標蛋白中PTMs的功能。在早期的研究中,乙?;揎椧恢北徽J為是...
蛋白翻譯后修飾:蛋白質氨基酸序列的特定位置可以與化學基團或者小分子量的蛋白共價結合從而發(fā)生蛋白質翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質生物合成的一個步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙?;⑻腔?、泛素化和二硫鍵等等,它導致蛋白質組復雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質,各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質的結構和功能來促進細胞快速變化的方法。PTMs在信號轉導、蛋白質穩(wěn)定性和周轉率、蛋白質與蛋白質識別和相互作用以及空間定位中起著至關重要的作用。質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測...
蛋白質乙?;揎椊M學技術:乙?;揎検求w內保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?;碾亩?,從而實現(xiàn)乙?;蔫b定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)模混合蛋白質):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。浙江蛋白質磷酸化修飾組學一...
蛋白質乙?;揎椊M學定量分析:1. SILAC細胞標記,組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質(基于SILAC的乙?;揎椊M學定量)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記(基于iTRAQ的乙?;揎椊M學定量)。4. 使用高效特異性乙?;贵w對乙?;揎楇亩芜M行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙?;亩芜M行序列分析。6. 數(shù)據(jù)分析,比對不同樣本中蛋白乙?;揎椝讲町悾Ξa(chǎn)生變化的生物學意義進行解釋。蛋白質的翻譯后修飾調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。貴陽甲基化修飾蛋白質組學主要方式蛋白質翻譯后修飾組學:蛋白質翻譯后修飾(Post-...
質譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于蛋白質印跡等技術,質譜技術能更有效的對蛋白質的翻譯后修飾進行分析,且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因為質譜是通過蛋白質序列內的多個肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性。湖北亞硝基化修飾蛋白質組學質譜鑒...