質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù),質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行分析,且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進(jìn)行補充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因為質(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機(jī)會。一種提高質(zhì)譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進(jìn)行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進(jìn)行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質(zhì)乙?;揎棧櫭剂x指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎(chǔ)上面嫁接上乙?;鶊F(tuán)。廣東棕...
蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型:根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同,可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類,即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?;姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸(如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 ?;姿猁}蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來檢測復(fù)雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意...
蛋白翻譯后修飾:蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化和二硫鍵等等,它導(dǎo)致蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質(zhì),各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來促進(jìn)細(xì)胞快速變化的方法。PTMs在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識別和相互作用以及空間定位中起著至關(guān)重要的作用。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括...
質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾:相對于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù),質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行分析,且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進(jìn)行補充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因為質(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機(jī)會。一種提高質(zhì)譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進(jìn)行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進(jìn)行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。四川蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)一般流程蛋白翻譯后修...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程,是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機(jī)體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機(jī)體分泌、滲漏、脫落的蛋白質(zhì),其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì)。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象、生物活性、運輸和定位,而且在分子識別、細(xì)胞通信、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。因此對血漿蛋白糖基化進(jìn)行分析,有助于研究血漿蛋白的生理功能等。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。貴陽蛋白質(zhì)琥珀?;?..
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:質(zhì)譜鑒定法:在質(zhì)譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質(zhì)比的離子,然后經(jīng)加速電場的作用,生成離子束,進(jìn)入質(zhì)量分析器。在質(zhì)量分析器中,在磁場的作用下,質(zhì)荷比相同的離子會被聚焦到同一點上,不同質(zhì)荷比的離子聚焦于不同點上,因此獲得區(qū)分不同質(zhì)荷比離子的質(zhì)譜圖。與未經(jīng)修飾的肽段相比,磷酸基團(tuán)修飾的肽段在相對分子質(zhì)量上就會增加79.983,由此在質(zhì)譜圖中能夠與未修飾肽段進(jìn)行區(qū)分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團(tuán)與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團(tuán),從而達(dá)到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結(jié)...
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類型:翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解,其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上,通過基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物。翻譯后修飾在哪里發(fā)生?翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端?,F(xiàn)有的官能團(tuán)或新官能團(tuán)的引入可被用于修飾蛋白質(zhì),以擴(kuò)展20個標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)組成。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學(xué)反應(yīng)中充當(dāng)親核試劑的官能團(tuán),如絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基;賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式;同時,在蛋白質(zhì)的N端和C端,天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點。...
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進(jìn)步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術(shù)可以直接對完整的蛋白質(zhì)進(jìn)行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術(shù)對蛋白質(zhì)的有效分辨率已達(dá)到229...
蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)技術(shù):乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙?;碾亩?,從而實現(xiàn)乙酰化的鑒定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標(biāo)蛋白質(zhì)):目標(biāo)蛋白總量>50μg,目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)模混合蛋白質(zhì)):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用。江蘇琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)價格什么是蛋白質(zhì)的...
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉(zhuǎn)移解離(ETD)的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用,對樣品進(jìn)行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行,但是由于估計適當(dāng)?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結(jié)果進(jìn)行過濾。自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進(jìn)行片段化,不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。蛋白質(zhì)翻譯后...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合,調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有有效性。哈爾濱蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)分析蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略,包括質(zhì)譜(MS)、Eastern blotting、放射...
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉(zhuǎn)移解離(ETD)的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用,對樣品進(jìn)行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行,但是由于估計適當(dāng)?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結(jié)果進(jìn)行過濾。自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進(jìn)行片段化,不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。在細(xì)胞中,乙...
蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開關(guān)在時空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設(shè)計抑制劑,用于疾...
蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化。蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學(xué)意義?蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)鑒定蛋白磷酸化檢測方法:質(zhì)譜檢測方法優(yōu)勢:1. 準(zhǔn)確度高...
什么是蛋白質(zhì)的翻譯后修飾?蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(post-translational-modification-analysis.html)是指蛋白質(zhì)在翻譯后的化學(xué)修飾。對于大部分的蛋白質(zhì)來說,這是蛋白質(zhì)生物合成的較后步驟。PTM是細(xì)胞信號傳導(dǎo)中的重要組成部分。通過向修飾基團(tuán)添加一個或多個氨基酸殘基或通過蛋白質(zhì)水解切割該基團(tuán)來改變蛋白質(zhì)的性質(zhì),是蛋白質(zhì)生物學(xué)功能表達(dá)的重要步驟。生物蛋白質(zhì)的翻譯后修飾極大地增加了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的類型和功能。這個過程調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄,并影響表觀遺傳學(xué)。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?廣東蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互...
翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究的工作不只聚焦于細(xì)胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化,許多至關(guān)重要的生命進(jìn)程不只由蛋白質(zhì)相對豐度控制,更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復(fù)雜多樣的生物功能的一個重要前提。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時其分子質(zhì)量會發(fā)生響應(yīng)的改變,通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。同時,發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動態(tài)范圍廣,所以在質(zhì)譜檢測前需要對發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進(jìn)行富集。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。武漢蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而...
翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析。通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,其序列信息和分子量是確定的。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,由于序列信息和分子量是確定的,磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,假設(shè)這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級質(zhì)譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化。深圳蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)方法蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義?在哺乳動物細(xì)胞生命周期中,...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程,是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機(jī)體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機(jī)體分泌、滲漏、脫落的蛋白質(zhì),其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì)。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象、生物活性、運輸和定位,而且在分子識別、細(xì)胞通信、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。因此對血漿蛋白糖基化進(jìn)行分析,有助于研究血漿蛋白的生理功能等。蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)。江蘇糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類型蛋白...
蛋白磷酸化檢測方法:質(zhì)譜檢測方法優(yōu)勢:1. 準(zhǔn)確度高,能夠同時檢測多個蛋白的多個磷酸化位點。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實際應(yīng)用中,Western Blot與質(zhì)譜分析方法各有各的好,誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測定磷酸化修飾的時候還應(yīng)該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體,那么lucky you,你可以選擇Western Blot進(jìn)行快速磷酸化測定研究。但是如果你所研究的蛋白質(zhì)沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體,或是抗體價效過低,亦或是需要大規(guī)模地檢測細(xì)胞內(nèi)磷酸化蛋白的水平的話,質(zhì)譜檢測會是更好地選擇。自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用...
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法: Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳通過連接在丙烯酰胺分子上的雙核金屬(如Mn2+)配合物對磷酸基團(tuán)的親和,造成磷酸化蛋白遷移的滯留,再將電泳結(jié)果轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用相應(yīng)蛋白的抗體識別,根據(jù)遷移滯留檢測蛋白磷酸化。技術(shù)優(yōu)勢特點:1、無放射危害。2、鑒定不受限于特異性識別蛋白質(zhì)磷酸化的抗體。3、適用于大規(guī)模磷酸化蛋白分析。4、與質(zhì)譜鑒定兼容,進(jìn)行更為精細(xì)的分析鑒定。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的功能。深圳蛋白質(zhì)丙?;揎椊M學(xué)有哪些類型蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋...
蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機(jī)制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?;?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開關(guān)在時空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設(shè)計抑制劑,用于疾...
蛋白質(zhì)乙酰化修飾鑒定流程:1. 組織/細(xì)胞破碎,提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?;贵w對乙?;揎楇亩芜M(jìn)行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?;亩芜M(jìn)行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析,并對鑒定的乙酰化位點的生物學(xué)功能進(jìn)行解釋預(yù)測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展,我們越來越深刻地意識到,對于生物體生命活動的管理和調(diào)控過程,密切相關(guān)的不只是單個蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài),更重要的是研究蛋白質(zhì)組學(xué)水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術(shù)和豐富的、準(zhǔn)確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學(xué)成為現(xiàn)實,借助這些組學(xué)研究手段...
蛋白翻譯后修飾組學(xué)技術(shù)在準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用:盡管目前大數(shù)據(jù)的獲得會采用基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué),但是關(guān)鍵的發(fā)現(xiàn)還是依賴蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學(xué)驅(qū)動的準(zhǔn)確的醫(yī)學(xué)具有極大的實用性和普適性,蛋白組學(xué)的研究更加速了臨床轉(zhuǎn)化的進(jìn)程。蛋白翻譯后修飾(post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化,研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾(磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位點,還可以發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)記物及探索藥物/化學(xué)調(diào)節(jié)物的作用機(jī)制。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性。上海丙二?;揎椀鞍踪|(zhì)...
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化。貴州泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格...
蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)技術(shù):泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標(biāo)蛋白質(zhì)):目標(biāo)蛋白總量>50μg,目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)?;旌系鞍踪|(zhì)):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。武漢蛋白質(zhì)丙酰化修飾組學(xué)領(lǐng)域翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個細(xì)胞過程的重...
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù):技術(shù)優(yōu)勢特點。1、 檢測特異性高。2、能夠特異鑒定單個磷酸化位點。同位素標(biāo)記(Isotope Labeled)結(jié)合免疫印跡法:此方法的原理是當(dāng)?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時,放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過免疫印跡方法檢測同位素標(biāo)記,從而達(dá)到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術(shù)優(yōu)勢特點:1、檢測技術(shù)靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應(yīng)結(jié)果檢測。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時分析多個蛋白磷酸化。蛋白質(zhì)磷酸化修飾怎么定義?南京蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾組學(xué)領(lǐng)域什么是蛋白質(zhì)的翻譯后修飾?蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(post-translation...
蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,組蛋白的甲基化、乙酰化修飾能夠調(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙酰化修飾普遍存在于人的多種代謝酶之中,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙?;?。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。湖北琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)研究翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:在蛋白翻譯后修飾方式的...
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法: Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳通過連接在丙烯酰胺分子上的雙核金屬(如Mn2+)配合物對磷酸基團(tuán)的親和,造成磷酸化蛋白遷移的滯留,再將電泳結(jié)果轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用相應(yīng)蛋白的抗體識別,根據(jù)遷移滯留檢測蛋白磷酸化。技術(shù)優(yōu)勢特點:1、無放射危害。2、鑒定不受限于特異性識別蛋白質(zhì)磷酸化的抗體。3、適用于大規(guī)模磷酸化蛋白分析。4、與質(zhì)譜鑒定兼容,進(jìn)行更為精細(xì)的分析鑒定。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時其分子質(zhì)量會發(fā)生響應(yīng)的改變,通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。貴陽蛋白質(zhì)甲基化修飾組學(xué)服務(wù)蛋白翻譯...
質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設(shè)這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。在早...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測到修飾肽的機(jī)會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻?;S捎趯-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚?;揎椀鞍讈喫揭约笆杷院蜐撛诓环€(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;摹,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩δ繕?biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。蛋白質(zhì)糖基...