蛋白翻譯后修飾組學技術在準確醫(yī)學中的應用:盡管目前大數(shù)據(jù)的獲得會采用基因組學和轉錄組學,但是關鍵的發(fā)現(xiàn)還是依賴蛋白質組數(shù)據(jù)而得到的。近來越來越多的研究表明蛋白組學驅動的準確的醫(yī)學具有極大的實用性和普適性,蛋白組學的研究更加速了臨床轉化的進程。蛋白翻譯后修飾(post-ranslational modification, PTM)賦予了蛋白種類的豐富性及蛋白功能的多樣化,研究蛋白翻譯后修飾不只可以確定蛋白修飾(磷酸化、泛素化、?;?、甲基化、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位點,還可以發(fā)現(xiàn)生物標記物及探索藥物/化學調節(jié)物的作用機制。蛋白質的翻譯后修飾調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。四川蛋白質琥珀?;揎椊M學領域
蛋白質磷酸化修飾組學:蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種比較普遍的調控手段。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調節(jié)著包括細胞的增殖、發(fā)育、分化、細胞骨架調控、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的所有過程,并且可逆的蛋白質磷酸化是目前所知道的比較主要的信號轉導方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導致的后果。貴陽蛋白質亞硝基化修飾組學分析蛋白質翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術對蛋白質的有效分辨率已達到229kDa,一次可以檢測到的蛋白質數(shù)量也在增加。
什么是蛋白質的翻譯后修飾?蛋白質的翻譯后修飾()是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導中的重要組成部分。通過向修飾基團添加一個或多個氨基酸殘基或通過蛋白質水解切割該基團來改變蛋白質的性質,是蛋白質生物學功能表達的重要步驟。生物蛋白質的翻譯后修飾極大地增加了蛋白質結構的類型和功能。這個過程調節(jié)細胞周期和蛋白質轉錄,并影響表觀遺傳學。常見的蛋白質翻譯后修飾包括磷酸化。
蛋白質磷酸化修飾鑒定方法: Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳通過連接在丙烯酰胺分子上的雙核金屬(如Mn2+)配合物對磷酸基團的親和,造成磷酸化蛋白遷移的滯留,再將電泳結果轉移到PVDF膜上,用相應蛋白的抗體識別,根據(jù)遷移滯留檢測蛋白磷酸化。技術優(yōu)勢特點:1、無放射危害。2、鑒定不受限于特異性識別蛋白質磷酸化的抗體。3、適用于大規(guī)模磷酸化蛋白分析。4、與質譜鑒定兼容,進行更為精細的分析鑒定。蛋白質乙?;揎椊M學技術對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。蛋白質亞硝基化修飾組學研究
通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復雜性。四川蛋白質琥珀?;揎椊M學領域
蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:質譜鑒定法:在質譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質比的離子,然后經(jīng)加速電場的作用,生成離子束,進入質量分析器。在質量分析器中,在磁場的作用下,質荷比相同的離子會被聚焦到同一點上,不同質荷比的離子聚焦于不同點上,因此獲得區(qū)分不同質荷比離子的質譜圖。與未經(jīng)修飾的肽段相比,磷酸基團修飾的肽段在相對分子質量上就會增加79.983,由此在質譜圖中能夠與未修飾肽段進行區(qū)分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團,從而達到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來。但是這個方法不能夠有效富集不與IMAC結合的磷酸化肽段。四川蛋白質琥珀?;揎椊M學領域
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