蛋白翻譯后修飾：蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學基團或者小分子量的蛋白共價結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs）。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個步驟，翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾，PTMs的類型包括磷酸化、乙?；⑻腔?、泛素化和二硫鍵等等，它導致蛋白質(zhì)組復雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質(zhì)，各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來促進細胞快速變化的方法。PTMs在信號轉(zhuǎn)導、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識別和相互作用以及空間定位中起著至關重要的作用。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化。武漢乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學有哪些類型

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的檢測方法：質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術之一，可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs），如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等，大幅度的增加了蛋白質(zhì)組的復雜性。檢測蛋白質(zhì)的翻譯后修飾，了解它們?nèi)绾喂ぷ?、影響蛋白質(zhì)組和調(diào)控基因組將極大地提高我們對遺傳學和表觀遺傳學的理解。目標蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟，因為修飾蛋白的豐度一般較低。大多數(shù)PTMs檢測方法都是結(jié)合富集策略開發(fā)的，以比較好的識別、驗證和研究目標蛋白中PTMs的功能。泛素化修飾蛋白質(zhì)組學鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學定量分析：1. SILAC細胞標記，組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)（基于SILAC的乙?；揎椊M學定量）。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記（基于iTRAQ的乙酰化修飾組學定量）。4. 使用高效特異性乙酰化抗體對乙?；揎楇亩芜M行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行序列分析。6. 數(shù)據(jù)分析，比對不同樣本中蛋白乙?；揎椝讲町?，并對產(chǎn)生變化的生物學意義進行解釋。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學技術優(yōu)點：1、全方面性：磷酸化蛋白質(zhì)組學以整個細胞蛋白為研究對象，研究內(nèi)容包括了細胞內(nèi)具有生命功能的蛋白，如細胞增生、細胞分裂和細胞分化等相關蛋白，因而研究更為全方面。2、可靠性：傳統(tǒng)的生物學研究蛋白質(zhì)磷酸化往往針對特定條件，以兩個蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發(fā)點，具有局限性，缺乏整體認識。磷酸化蛋白質(zhì)組學則可檢測不同蛋白激酶及磷酸化酶對同一個蛋白磷酸化程度的影響，因而結(jié)果具有普遍性和可靠性。3、有效性：磷酸化蛋白質(zhì)組學反映的是細胞內(nèi)真實發(fā)生的事件，在一次試驗中考慮了不同變量，克服了生物學中逐步添加變量的缺陷。4、探索性：磷酸化蛋白質(zhì)組學以細胞內(nèi)蛋白為研究對象，相對于傳統(tǒng)的生物學研究以及蛋白質(zhì)芯片，更易發(fā)現(xiàn)未知的新磷酸化位點和磷酸化蛋白質(zhì)。如果可以聯(lián)合生物學技術，則可以發(fā)現(xiàn)具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。在眾多乙酰化修飾的蛋白質(zhì)中，研究較多的要數(shù)細胞核中包圍DNA的組蛋白了。

蛋白質(zhì)修飾位點分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性，從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾?？蓹z測修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙?；⒎核鼗?、丙?；?、丁?；⒈；?、戊二?；㈢牾；?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化：信號轉(zhuǎn)導、細胞周期、生長發(fā)育機理等；2、糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應答等；3、乙?；夯虮磉_調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等；4、泛素化：細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復以及信號轉(zhuǎn)導等；5、甲基化：染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；6、丙?；?/ 丙二?；?/ 戊二?；?/ 琥珀酰化：主要存在于線粒體和細菌中，與代謝過程密切相關。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用。深圳蛋白質(zhì)丙二?；揎椊M學主要方式

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學具有可靠性。武漢乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學有哪些類型

蛋白磷酸化檢測方法：質(zhì)譜檢測方法優(yōu)勢：1. 準確度高，能夠同時檢測多個蛋白的多個磷酸化位點。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實際應用中，Western Blot與質(zhì)譜分析方法各有各的好，誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測定磷酸化修飾的時候還應該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體，那么lucky you，你可以選擇Western Blot進行快速磷酸化測定研究。但是如果你所研究的蛋白質(zhì)沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體，或是抗體價效過低，亦或是需要大規(guī)模地檢測細胞內(nèi)磷酸化蛋白的水平的話，質(zhì)譜檢測會是更好地選擇。武漢乙酰化修飾蛋白質(zhì)組學有哪些類型