circRNA轉錄組學：是一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′ 帽子結構和3′ poly（A）結構，主要位于細胞質或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定且不易降解，已被證明普遍存在于多種真核生物體內。大多數circRNA是由外顯子環(huán)化而成，也有部分circRNA是由內含子環(huán)化而成的套索結構。轉錄組學為什么原核物種只能做有參轉錄組分析？由于原核生物的基因組中存在大量基因重疊區(qū)域、操縱子及多順反子，如果按照無參轉錄組分析策略進行組裝的話，難度較大，組裝結果存在較大風險。轉錄組學檢測范圍廣，高于6個數量級的動態(tài)檢測范圍。深圳IncRNA轉錄組學技術

單細胞轉錄組學技術：Anydeplete技術首先通過隨機引物進行一鏈合成，一鏈合成引入核苷酸類似物，用于酶切打斷，二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭，接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物，用于酶切降解。當形成單鏈文庫后，設計特異性引物與rRNA形成文庫結合，一輪退火延伸，rRNA文庫形成雙鏈結構。Reverseadaptor上帶有特異的酶切位點，當形成雙鏈結構酶切位點被識別，切去接頭，這樣rRNA形成的文庫不帶有完整的接頭，而其他文庫帶有完整接頭，通過PCR擴增富積既能得到想要的信息，包含mRNA及LncRNA信息。同樣Anydeplete技術與10×genomics技術一樣，包含分子標簽，可分析duplication及PCR產生突變位點。杭州宏轉錄學組研究轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。

轉錄組學測序有什么樣的樣品要求？（1）樣品純度要求：OD值應在1.8至2.2之間；電泳檢測28S:18S至少大于1.8。（2）樣品濃度：totalRNA濃度不低于400ng/μg。（3）totalRNA樣品請置于-20℃保存；請?zhí)峁﹖otalRNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源。請同時附上QC數據，包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數據。（4）樣品請置于1.5ml管中，管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間，管口使用Parafilm封口。建議使用干冰運輸，并且盡量選用較快的郵遞方式，以降低運輸過程中樣品降解的可能性。

轉錄組學為什么原核物種只能做有參轉錄組分析？由于原核生物的基因組中存在大量基因重疊區(qū)域、操縱子及多順反子，如果按照無參轉錄組分析策略進行組裝的話，難度較大，組裝結果存在較大風險。轉錄組學差異基因數目多少比較合理？不同的處理，不同的研究目標，差異基因的數目是不同的，從幾十個到幾千個都有可能。但是如果差異基因數目是個位數或者上萬，那么就需要和分析人員溝通一下，查一查是否有問題。轉錄組學差異基因太多，注釋信息太雜亂，怎么挑選目標基因？對不同的差異組合進行維恩圖分析，挑選共有或者特有的差異基因作為后續(xù)的研究對象；根據前人的文獻報道，挑選相關差異基因，不要局限在自己研究的物種上。circRNA主要存在于細胞質或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。

轉錄組及轉錄組測序（RNA-seq）：轉錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的mRNA的表達量，進而對相關基因和表型的關系進行分析。本質上講RNA-seq就是在用一種新的方法實現(xiàn)“基因決定性狀”的經典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達分析的主要技術是基因芯片，不過由于高通量測序成本的下降，RNA-seq的運用愈來愈普遍。轉錄組學有高通量、更精確的數字信號。深圳IncRNA轉錄組學技術

轉錄組學可以直接測定每個轉錄本單核苷酸分辨率的準確度。深圳IncRNA轉錄組學技術

轉錄組學研究的方法：轉錄組學是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規(guī)律的學科。在早期，由于測序價格昂貴、基因序列數目有限，轉錄組學研究者只能進行極少數特定基因的結構功能分析和表達研究。近十幾年，分子生物學技術的快速發(fā)展使高通量分析成為可能，這為真正意義上的轉錄組學的研究奠定了基礎。這些高通量研究方法主要可以分為兩類：一類是基于這類方法包括表達序列標簽技術、基因表達系列分析技術、大規(guī)模平行測序技術、RNA測序技術其中。深圳IncRNA轉錄組學技術