逆轉(zhuǎn)錄酶是存在于RNA病毒體內(nèi)的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實(shí)驗(yàn)中的逆轉(zhuǎn)錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補(bǔ)的雙鏈DNA。在選擇逆轉(zhuǎn)錄酶時(shí),建議選擇無RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉(zhuǎn)錄酶。具有RNaseH活性的逆轉(zhuǎn)錄酶的RNaseH活性會(huì)與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產(chǎn)量與長度。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。石家莊莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄酶
反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng),在進(jìn)行RT反應(yīng)之前,應(yīng)考慮以下幾個(gè)方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質(zhì)量的RNA,高質(zhì)量的RNA至少應(yīng)保證全長并且不含逆轉(zhuǎn)錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時(shí)在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中經(jīng)常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產(chǎn)量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應(yīng)中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因?yàn)閏DNA合成前的過程會(huì)使抑制劑變性,從而釋放結(jié)合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實(shí)驗(yàn)過程中經(jīng)常更換新手套。成都miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑穩(wěn)定性高逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)中引物設(shè)計(jì)時(shí)要注意反向引物特異性和長度,避免循環(huán)擴(kuò)增和特異性問題。
逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)流程:從細(xì)胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、dNTPs的反應(yīng)體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉(zhuǎn)錄酶合成互補(bǔ)cDNA鏈變性→常規(guī)PCR反應(yīng)流程(變性、退火、延伸,如此多次循環(huán))。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實(shí)驗(yàn)操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構(gòu)建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應(yīng)在同一Buffer及酶中進(jìn)行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進(jìn)行PCR,即RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增分兩步進(jìn)行。
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余,反向引物就無處安放了。那么如何實(shí)現(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:但其對RNA的完整度和二級結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機(jī)引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。實(shí)時(shí)熒光PCR檢測需要經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)步驟:用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行RT(20ul體積)1、準(zhǔn)備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、-20℃保存,或立即進(jìn)行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個(gè)區(qū)域起始,并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率,較大程度保證qPCR結(jié)果的真實(shí)性和可重復(fù)性。逆轉(zhuǎn)錄PCR反應(yīng)過程中要注意反應(yīng)管中溶液面積不宜過高,避免泡沫問題。成都miQP2逆轉(zhuǎn)錄試劑穩(wěn)定性高
逆轉(zhuǎn)錄PCR是較常用的逆轉(zhuǎn)錄應(yīng)用之一。石家莊莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄是一種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,它在生物體內(nèi)發(fā)揮著重要的作用。逆轉(zhuǎn)錄是指將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA的過程,與正常的DNA轉(zhuǎn)錄成RNA的過程相反。這個(gè)過程由逆轉(zhuǎn)錄酶來完成,而逆轉(zhuǎn)錄酶是一種酶類蛋白質(zhì),普遍存在于病毒和一些細(xì)胞中。逆轉(zhuǎn)錄的重要性在于它是某些病毒的復(fù)制過程中必不可少的一步。許多病毒的遺傳物質(zhì)是RNA分子,而它們必須先將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA,才能利用細(xì)胞的合成機(jī)制來進(jìn)行復(fù)制。這種轉(zhuǎn)錄過程一旦完成,病毒的DNA就可以與宿主細(xì)胞的DNA結(jié)合在一起,從而使病毒的遺傳物質(zhì)被復(fù)制并傳遞下去。石家莊莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄酶
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