質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾：相對于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù)，質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進行分析，且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾，因為質(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個肽段來鑒定的，這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質(zhì)譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集，而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集，這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學領(lǐng)域

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學：磷酸化蛋白質(zhì)是由蛋白激酶將ATP或GTP分子上的磷酸基團轉(zhuǎn)移到底物蛋白特定的氨基酸側(cè)鏈上形成的。蛋白質(zhì)磷酸化是一種可逆的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。在哺乳動物的細胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化修飾。磷酸化修飾參與許多信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和細胞代謝過程，且許多已知的疾病也與蛋白質(zhì)的異常磷酸化有關(guān)。因此，對磷酸化蛋白質(zhì)組進行定量研究，尋找差異表達的磷酸化蛋白質(zhì)，有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標志物和尋找新的具有診療潛力的藥物靶標。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學領(lǐng)域蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合，調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用，翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間，并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預(yù)測酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點。

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質(zhì)的電性,疏水性和空間結(jié)構(gòu)等屬性,為與之結(jié)合的蛋白提供結(jié)合的錨定或產(chǎn)生位阻效應(yīng),像一把開關(guān)在時空上精確調(diào)控蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結(jié)構(gòu)研究表明,蛋白質(zhì)之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結(jié)合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結(jié)合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設(shè)計抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質(zhì)修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙?；?、泛素化、丙?；⒍□；⒈；?/p>

蛋白質(zhì)學組翻譯后修飾的研究策略：目前，有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略，包括質(zhì)譜（MS）、Eastern blotting、放射性標記和Western blotting。放射性標記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對定量的方法。該過程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質(zhì)譜技術(shù)也常被用于翻譯后修飾分析，不受修飾類型和相關(guān)修飾位點的現(xiàn)有知識的限制。自下而上：自下而上的技術(shù)是蛋白質(zhì)組學研究中使用的質(zhì)譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前，需要使用蛋白酶消化蛋白質(zhì)。由于該技術(shù)不能保證在檢測過程中被檢測肽的完整性和穩(wěn)定性，因此無法獲得不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間關(guān)系的信息，這意味著它無法檢測到某些修飾。因此，該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。深圳丙二?；揎椀鞍踪|(zhì)組學服務(wù)

蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學領(lǐng)域

乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學分析：乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學分析是指從蛋白質(zhì)組學的水平分析蛋白質(zhì)乙?；揎棧ㄒ阴；鞍踪|(zhì)的鑒定和定量。提供基于質(zhì)譜的乙?；鞍捉M研究服務(wù)。蛋白質(zhì)乙酰化包括組蛋白乙?；头墙M蛋白乙酰化。組蛋白乙酰化主要是賴氨酸乙?；?，已在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙?；瘶?gòu)成了哺乳動物細胞中乙?；鞍椎闹饕糠?，參與了所有主要生物過程，包括蛋白質(zhì)的定位、轉(zhuǎn)移、功能和降解，遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制等。除了重要的生物學功能以外，乙?；鞍踪|(zhì)及其調(diào)控酶還與衰老和多種疾?。ㄈ缟窠?jīng)變形紊亂、心血管疾病等）緊密相關(guān)。因此，對乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組進行研究有助于進一步探索細胞的生命活動與了解相關(guān)疾病的發(fā)病機制。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學領(lǐng)域

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