轉錄組學應用領域:農林領域:生長發(fā)育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業(yè):生長發(fā)育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質研究等;海洋水產:生長發(fā)育機制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產品安全等;微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發(fā),個性化醫(yī)治等;環(huán)境科學:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產,環(huán)境危害風險評估研究等;食品科學:食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。轉錄組學可以對任意物種進行全基因組分析。武漢單細胞轉錄組學檢測價格
宏轉錄學組的概念:宏轉錄組是特定時期、環(huán)境樣本、組織樣本中所有的微生物的RNA(轉錄本)的匯合。通過對這些轉錄本進行大規(guī)模高通量測序,可以直接獲得環(huán)境中可培養(yǎng)和不可培養(yǎng)的微生物轉錄組信息。這種技術不只具有宏基因組技術的全部優(yōu)點,可以檢測環(huán)境中的活性微生物、活性轉錄本以及活性功能進行研究,還可以比較不同環(huán)境下的差異表達基因和差異功能途徑,揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應機制,探索環(huán)境與微生物之間的互作機理。浙江IncRNA轉錄組學質譜分析轉錄組學測序必須做生物學重復么?
什么叫轉錄組轉錄組學?1、轉錄組,廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的組合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉運RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的組合。2、轉錄組學,是指一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規(guī)律的學科。轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。以DNA為模板合成RNA的轉錄過程是基因表達的第一步,也是基因表達調控的關鍵環(huán)節(jié)。
轉錄組學含義:轉錄組學是指一門在整體水平上研究細胞中基因轉錄的情況及轉錄調控規(guī)律的學科。轉錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉錄組即一個活細胞所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。以DNA為模板合成RNA的轉錄過程是基因表達的第一步,也是基因表達調控的關鍵環(huán)節(jié)。所謂基因表達,是指基因攜帶的遺傳信息轉變?yōu)榭杀鎰e的表型的整個過程。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環(huán)境下,其基因表達情況是不完全相同的。通常,同一種組織表達幾乎相同的一套基因以區(qū)別于其他組織,如腦組織或心肌組織等分別只表達全部基因中不同的30%而顯示出組織的特異性。轉錄組學檢測范圍廣,高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍。
轉錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內的完整轉錄信息的匯合,表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。蛋白質是生命功能的直接執(zhí)行者,蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。整合轉錄組學和蛋白質組學的表達數(shù)據(jù)對生物樣本進行研究,可以從整體上解釋生物學問題,探究生物體生理和疾病機理等。轉錄組學應用于胃腸瘤發(fā)生機制研究:利用轉錄組學可檢測瘤細胞惡化過程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機制。廣義轉錄組學是一個特定細胞所有轉錄本的總和。浙江IncRNA轉錄組學質譜分析
轉錄組學測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?武漢單細胞轉錄組學檢測價格
RNA-seq轉錄組學技術優(yōu)勢有:1、可以直接測定每個轉錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度;2、靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本;3、可以對任意物種進行全基因組分析,能夠檢測未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉錄本,并準確地識別可變剪切位點及cSNP,UTR區(qū)域;4、檢測范圍廣,能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。RNA-seq轉錄組學是需要生物學重復的,至少需要兩次生物學重復,3次以上的生物學重復更好。以3個重復為例,加上對照的三個生物學重復,一次RNA-seq需要6個樣本。武漢單細胞轉錄組學檢測價格