iTRAQ/TMT標記定量蛋白質(zhì)組介紹:iTRAQ/TMT標記定量蛋白質(zhì)組研究是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行標記,利用標記試劑中的二級報告離子來對蛋白進行精確鑒定和定量。技術(shù)優(yōu)勢:1、適用范圍廣:可檢測到的蛋白除了胞漿蛋白外,還有線粒體蛋白、膜蛋白。也能對任何類型的蛋白質(zhì)進行鑒定,包括高分子量,酸性,堿性蛋白質(zhì);2、高通量:一次可以實現(xiàn)多個樣品的定性定量分析,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并帶領(lǐng)生物技術(shù)取得關(guān)鍵性的突破。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組學(xué)的目標是要回答關(guān)于蛋白質(zhì)的4個方面的問題:①細胞中蛋白質(zhì)的含量。②定位。③活性。④修飾。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法主要有:①蛋白質(zhì)雙向電泳。②氨基酸序列測定(包括N端測序和C端測序)。③質(zhì)譜。④生物信息學(xué)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)指在某一特定的生長發(fā)育時期,在特定的生長條件下,特定的細胞、組織中所表達的所有蛋白質(zhì)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)揭示了在每個特定時期所表達的蛋白質(zhì)和這些不同的蛋白質(zhì)在特殊的生長時期可能發(fā)揮的作用,是進一步了解和深入研究蛋白質(zhì)功能的基礎(chǔ)。武漢高通量蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展,我認為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細胞癥)、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計,應(yīng)該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目,采用基于質(zhì)譜(或二維膠等手段)的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨特的技術(shù)優(yōu)勢。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)方法開發(fā)和驗證周期短,在中高級特殊應(yīng)用(如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制)中也有其獨特優(yōu)勢。
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時,其靜電荷數(shù)為零,在電場中不再移動,據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對提高我國生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。
蛋白質(zhì)組研究:蛋白質(zhì)組研究是指系統(tǒng)研究在某一特定時間、特定條件下,某一種特定組織中的所有蛋白質(zhì)。對蛋白質(zhì)的研究也不只是局限于蛋白質(zhì)的氨基酸序列,而是包括了蛋白質(zhì)的表達量,蛋白質(zhì)活性,被修飾的狀況以及和其他蛋白質(zhì)或分子的相互作用情況、亞細胞定位和三維結(jié)構(gòu)。這些信息對于全方面了解復(fù)雜的生物系統(tǒng)有著重要的意義。因此,蛋白質(zhì)組學(xué)研究目標是大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究蛋白質(zhì)的特性,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動的分子網(wǎng)絡(luò)。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用為作物生長發(fā)育、病蟲害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學(xué)疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開辟新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)作物研究中的應(yīng)用:農(nóng)業(yè)是我國人口賴以生存的基礎(chǔ),而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵。蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應(yīng)答等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的應(yīng)用,為農(nóng)業(yè)作物的進一步開發(fā)利用提供巨大的參考價值。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達變化,有助于作物發(fā)育過程機制的理解。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究