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南京qPCR法病毒檢測原理

來源: 發(fā)布時間:2024-02-25

復制型病毒/病毒載體回復突變(ReplicationCompetentVirus,RCV),可產生于病毒載體制造過程中的所有步驟當中。并且,RCV感   染宿主細胞后能隨宿主細胞在培養(yǎng)液中增殖、擴增對人體健康具有嚴重的隱患,是免細胞治     療類產品,如CAR-T產品的主要安全性風險之一。近年來,CAR-T細胞制備過程中,伴隨載體的不斷升級優(yōu)化,重組產生的復制型逆轉錄病毒/慢病毒(ReplicationCompetentRetrovirus/Lentivirus,RCR/RCL)逐漸降低,但產生RCR/RCL的風險隱患至今仍不能完全排除。由2022年5月發(fā)布的《體外基因修飾系統(tǒng)學研究與評價技術指導原則(試行)》指出RCR/RCL檢測作為安全性檢測在細胞的研發(fā)和生產過程中至關重要,相關產品不得檢出RCR/RCL,可知病毒載體相關產品中,RCR/RCL病毒檢測至關重要。為什么要做復制型慢病毒檢測?南京qPCR法病毒檢測原理

用qPCR法進行rcAAV復制型腺相關病毒檢測時,出現擴增曲線異常的可能原因是什么?①軟件參數設置不當可能引起標曲參數或檢測結果異常。如擴增曲線信號早出現在14個循環(huán)左右,基線卻設置為3-15,導致儀器將14個循環(huán)出現的熒光信號默認為基線部分,出現結果異常。建議將BaselineEnd設置為擴增信號出現的前一個循環(huán),或由軟件自動設置。②擴增曲線飄起:該現象通常出現于高濃度模板情況下,擴增曲線Ct值在10以內的樣品。針對此類樣品檢測,設置標曲時建議盡量控制標曲蕞濃度Ct值控制在10以上。檢測樣品時建議對樣品進行稀釋后再測試。南京qPCR法病毒檢測原理復制型逆轉錄病毒檢測。

用qPCR進行rcAAV復制型腺相關病毒檢測時,哪些因素會對檢測結果準確性和方法靈敏度存在較大影響?參考品DNA量值溯源及質量保證:參考品DNA的量值準確與否,直接關系到樣品檢測結果的準確性,因此需制定完善的參考品量值溯源程序,確保結果準確可靠。參考品DNA的質量要求可從條帶大小、完整性、純度、濃度等方面做多評估,細胞來源的參考品應考察支原體污染,質粒參考品應考察質粒宿主E.coli基因組DNA殘留情況等,盡量排除干擾確保結果準確可靠。

盡管逆轉錄病毒和慢病毒載體被設計為具有復制缺陷,但仍有可能在生產過程中或輸注到患者體內后發(fā)生重組,從而產生新的具有復制能力的逆轉錄病毒/慢病毒(RCR/RCL)。FDA在有關細胞產品和患者中檢測RCR復制型逆轉錄病毒/RCL復制型慢病毒的指南中建議使用適當的生物學和/或分子檢測方法進行病毒載體、細胞產品和輸注后患者中的RCR復制型逆轉錄病毒/RCL復制型慢病毒檢測。南京正揚生物自主研發(fā)了可用于基于細胞培養(yǎng)方法的qPCR檢測以及CAR-T終產品qPCR檢測的RCL及RCR檢測專   用試劑盒,幫助研究者進行分析。南京正揚的重組腺相關病毒檢測試劑盒性能如何?

RCL/RCR病毒檢測的方法FDA推薦的RCL檢測方法是利用敏感細胞對病毒載體中可能存在的RCL進行培養(yǎng)擴增,并在培養(yǎng)終點進行檢測。?擴增期:將待測物與對HIV-1易感并且可大量擴增病毒的細胞系(通常用C8166)孵育,細胞傳代5次以上,培養(yǎng)至少3周。?指示期:3周后收集培養(yǎng)上清,接種于C8166細胞中培養(yǎng)7d后檢測RCL標志物。?檢測:A:P24ELLISA的方法:適用于由載體制備過程中病毒基因組之間的重組形成RCL的檢測。B:PERT法:當RCL進行擴增后,也可應用PERT檢測方法測定逆轉錄酶活性。該方法的缺點是在某些細胞中存在高背景。C:qPCR方法:采用實時定量PCR方法(Q-PCR)測定假型病毒CAR-T細胞醫(yī)治產品中重組腺相關病毒檢測的監(jiān)管要求。寧波RCL病毒檢測優(yōu)缺點

復制型病毒檢測試劑盒適用性樣品有哪些?南京qPCR法病毒檢測原理

用qPCR進行rcAAV復制型腺相關病毒檢測時,哪些因素會對檢測結果準確性和方法靈敏度存在較大影響?①qPCR引物探針的序列特異性:為保證方法高靈敏度和檢出率,用于qPCR檢測的特異序列必須是存在于高度保守區(qū)域內的穩(wěn)定序列,并且需要散布在基因組上,保證不會因工藝導致的殘留偏好而引起漏檢。②qPCR實驗室能力驗證:為滿足檢測要求,應對實驗室硬件和軟件能力進行確認。實驗室設計應按實驗流程分區(qū)操作,每個操作區(qū)域配置相應設施、設備及耗材,建立實驗室質量管理體系,考核實驗人員的操作能力及數據分析解讀能力等。南京qPCR法病毒檢測原理