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miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長時是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個重要表示。長春市一體化逆轉(zhuǎn)錄酶
反轉(zhuǎn)錄酶的用處:由它催化轉(zhuǎn)錄合成的DNA稱為互補(bǔ)DNA(cDNA)。通常情況下,細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄應(yīng)由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質(zhì)合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實(shí)現(xiàn)自身擴(kuò)增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA再由cDNA轉(zhuǎn)錄出RNA。逆轉(zhuǎn)錄酶可用RT—PCR,將RNA轉(zhuǎn)變?yōu)镈NA后擴(kuò)增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了反轉(zhuǎn)錄酶,并認(rèn)為此酶與病毒的致死性質(zhì)有關(guān)。反轉(zhuǎn)錄酶也分布于某些正常細(xì)胞和胚胎細(xì)胞。反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質(zhì)非?;?,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進(jìn)了分子生物學(xué)、生物化學(xué)和病毒學(xué)的研究,已成為研究這些學(xué)科的有力工具。南京莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑生產(chǎn)商逆轉(zhuǎn)錄的目的是將RNA變?yōu)镈NA,便于PCR擴(kuò)增。
RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄中模板的選擇:在RT-PCR實(shí)驗(yàn)中,選擇總RNA或純化的mRNA作為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄十分重要。mRNA雖然能提供略高的靈敏度,但總RNA經(jīng)常使用,具有較mRNA更重要的優(yōu)勢。首先,其過程需要較少的純化流程,這保證了更好的回收模板和更好的把結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化為起始的細(xì)胞數(shù)。第二,避免mRNA富集步驟,為了避免不同mRNA的回收率而帶來結(jié)果偏移的可能性。總之,在大多數(shù)的應(yīng)用中,目標(biāo)基因的相對定量比檢測的非常靈敏度更重要,因此在多數(shù)情況下,總RNA更適用。
逆轉(zhuǎn)錄酶實(shí)驗(yàn)流程:從細(xì)胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、dNTPs的反應(yīng)體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉(zhuǎn)錄酶合成互補(bǔ)cDNA鏈變性→常規(guī)PCR反應(yīng)流程(變性、退火、延伸,如此多次循環(huán))。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實(shí)驗(yàn)操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構(gòu)建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應(yīng)在同一Buffer及酶中進(jìn)行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進(jìn)行PCR,即RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增分兩步進(jìn)行。逆轉(zhuǎn)錄是2代測序、單細(xì)胞測序等技術(shù)的前置步驟。
逆轉(zhuǎn)錄酶的合成步驟:1、使用前每個組份輕輕混勻,然后2000rpm離心20s;2、取滅過菌且無核酸酶的0.2ml離心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保溫5min,然后冰浴5min;4、往3步驟中的0.2ml離心管依次加入下列組份:RNase抑制劑(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)1μL;5、輕輕混勻后,然后2000rpm離心20s;6、先在37℃保溫1hr,然后70℃保溫15min;7、上述產(chǎn)物可立即進(jìn)行下一步的PCR反應(yīng)或-20℃保存。逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:物理純度:在SDS-PAGE上>90%純。儲存緩沖液:20mMTris-HClpH7.5;200mMNaCl;0.1mMEDTA;1mMDTT;0.01%NP-40(一種去垢劑)和50%甘油。反應(yīng)緩沖液:250mMTris-HClpH8.3;375mMKCl;15mMMgCl2;50mMDTT(以Part#M531A供應(yīng))。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前要對反應(yīng)體系進(jìn)行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對照。南京莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑生產(chǎn)商
質(zhì)粒RNA檢測中的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)需要特定反應(yīng)體系。長春市一體化逆轉(zhuǎn)錄酶
反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據(jù)堿基配對的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉(zhuǎn)錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。長春市一體化逆轉(zhuǎn)錄酶