RT-PCR就是逆轉(zhuǎn)錄PCR或稱為反轉(zhuǎn)錄PCR(Reversetranscription-PCR,RT-PCR),是以RNA為材料應(yīng)用于PCR擴增中的一種實驗方法。首先通過逆轉(zhuǎn)錄酶將總RNA或信使RNA(mRNA)轉(zhuǎn)錄成互補DNA(cDNA)。其次TaqDNA聚合酶以cDNA為模板進行qPCR擴增。RT-PCR已被普遍應(yīng)用于多種分子生物學(xué)應(yīng)用中,包括基因表達分析、基因測試、RNA干擾驗證檢測、微陣列驗證、病原體檢測和疾病研究。RT-PCR的方法之一步法和兩步法:RT-PCR其操作方法分為兩種,即一步法和兩步法。一步法RT-PCR,逆轉(zhuǎn)錄同PCR擴增結(jié)合在一起,即cDNA合成與PCR擴增反應(yīng)在同一管Buffer及酶中進行,一步完成。兩步法RT-PCR,RNA首先在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下生成cDNA,再以cDNA為模板進行PCR擴增,分成兩步進行。逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。重慶cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算
逆轉(zhuǎn)錄酶實驗流程:從細胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、dNTPs的反應(yīng)體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉(zhuǎn)錄酶合成互補cDNA鏈變性→常規(guī)PCR反應(yīng)流程(變性、退火、延伸,如此多次循環(huán))。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構(gòu)建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應(yīng)在同一Buffer及酶中進行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進行PCR,即RNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增分兩步進行。上??焖俜崔D(zhuǎn)錄公司HIV病毒復(fù)制的一個重要步驟就是逆轉(zhuǎn)錄。
逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過程。所以相關(guān)研究可以為很多疾病的研究和防治提供幫助。逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑就一直是藥物研發(fā)熱點,例如抗HIV的nevirapine。逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏校對(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出錯。這也是很多病毒容易突變進化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不過,校對功能與逆轉(zhuǎn)錄活性并不矛盾。有人使用改良的定向進化策略從具有校對功能的DNA聚合酶(古細菌的DNA聚合酶B)進化出高保真的耐熱逆轉(zhuǎn)錄酶,稱為逆轉(zhuǎn)錄異種聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),證明校對與逆轉(zhuǎn)錄是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等過程,能夠提高精確度及簡化操作程序。
逆轉(zhuǎn)錄的過程與端粒復(fù)制,逆轉(zhuǎn)錄酶通常具有多種活性,如逆轉(zhuǎn)錄活性、復(fù)制活性與RNA酶H活性。逆轉(zhuǎn)錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。RNA酶H活性可以水解雜合雙鏈中的RNA,得到與RNA互補的DNA單鏈(cDNA)。復(fù)制活性則用來合成雙鏈DNA。HIV逆轉(zhuǎn)錄酶的活性部位。與復(fù)制類似,逆轉(zhuǎn)錄也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四個核苷酸的引物。各種DNA聚合酶活性都需要引物,只有確認(rèn)引物正確配對,才會進行DNA的合成。這是保證其忠實性的重要手段,逆轉(zhuǎn)錄酶也不例外。實驗室合成cDNA時,經(jīng)常會用合成的寡聚T(oligodT)作為引物,與mRNA的polyA配對。這個過程比較簡單,因為引物結(jié)合在RNA鏈的末端,所以整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄是一次性完成的。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。
逆轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)有重要的理論意義和實踐意義。對分子生物學(xué)的中心法則進行了修正和補充。經(jīng)典的中心法則認(rèn)為:DNA的功能兼有遺傳信息的傳遞和表達,因此,DNA處于生命活動的中心位置。逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達功能。修正后的中心法則表示為:是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。這是所有有細胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。某些病毒中的RNA自我復(fù)制和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過程(某些致死病毒)。有些亞病毒例如朊病毒,這種亞病毒沒有核酸,是一種因錯誤折疊而形成的結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì),以蛋白質(zhì)直接形成蛋白質(zhì),可促使與自身具有相同氨基酸序列的蛋白質(zhì)發(fā)生同樣的折疊錯誤,從而導(dǎo)致大量結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì)的形成。當(dāng)然,一般不認(rèn)為亞病毒屬于生物。逆轉(zhuǎn)錄引物的設(shè)計需要考慮反向引物的特性。上??焖俜崔D(zhuǎn)錄公司
逆轉(zhuǎn)錄后的DNA可用于構(gòu)建基因工程載體。重慶cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算
逆轉(zhuǎn)錄酶的合成步驟:1、使用前每個組份輕輕混勻,然后2000rpm離心20s;2、取滅過菌且無核酸酶的0.2ml離心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保溫5min,然后冰浴5min;4、往3步驟中的0.2ml離心管依次加入下列組份:RNase抑制劑(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)1μL;5、輕輕混勻后,然后2000rpm離心20s;6、先在37℃保溫1hr,然后70℃保溫15min;7、上述產(chǎn)物可立即進行下一步的PCR反應(yīng)或-20℃保存。逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:物理純度:在SDS-PAGE上>90%純。儲存緩沖液:20mMTris-HClpH7.5;200mMNaCl;0.1mMEDTA;1mMDTT;0.01%NP-40(一種去垢劑)和50%甘油。反應(yīng)緩沖液:250mMTris-HClpH8.3;375mMKCl;15mMMgCl2;50mMDTT(以Part#M531A供應(yīng))。重慶cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算