逆轉錄實驗的準備工作:1、實驗器具與材料:(1)移液頭:200ul、10ul;(2)吸頭:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、實驗器具的處理與準備,塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個浸泡于1‰DEPC水中(必要時小頭頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時左右烘干),試驗前將頭頭放入吸頭臺。3、試劑配制和準備:(1)DEPC水:泡實驗器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時后備用。逆轉錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶內裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,送至高壓,后分裝到幾個1。5mlEP管中,-20℃中保存?zhèn)溆谩#?)RT中所需要的各種試劑。逆轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。重慶一體化逆轉錄蛋白檢測
逆轉錄引物:加尾法逆轉錄引物的結構并不是想象中那么簡單的oligodT,其包含三個關鍵結構:①為了與PolyA序列互補配對,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR過程中反向引物與cDNA的結合。③OligodT序列的3端存在一個或兩個錨定堿基,V或者VN。(兼并堿基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一種)。如果沒有錨定堿基,逆轉錄引物中的OligodT就會隨機結合到PolyA的任意位置,這樣會造成同一miRNA的逆轉錄產物長度不一,給較后的熔解曲線檢測帶來麻煩。因此,錨定堿基的作用就是特異性地結合到miRNA上,從而讓逆轉錄引物結合到緊挨著miRNA的那段PolyA序列上。只有這樣,才能夠保證同一miRNA的逆轉錄產物大小相同。重慶一體化逆轉錄蛋白檢測逆轉錄酶是逆轉錄過程中的重要酶類。
逆轉錄的過程:生物體中的逆轉錄過程就比較復雜,比如逆轉錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經常有些基因是重疊、嵌套結構,充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發(fā)酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。
逆轉錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉錄酶的選擇,逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。多逆轉錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。逆轉錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。
miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA加尾法逆轉錄:增加miRNA逆轉錄產物長度較直接的方法就是增加miRNA的長度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后進行逆轉錄反應。因此,加尾法是由兩個酶共同作用完成的,它們分別是PolyA聚合酶和逆轉錄酶。PolyA聚合酶負責給miRNA加上PolyA尾,增加其長度。之后逆轉錄引物結合到PolyA序列上,由逆轉錄酶完成加長版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR中的qPCR:miRNA熒光定量PCR的過程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆轉錄產物的5端均為通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根據miRNA序列設計的正向引物。正向引物的特異性就變得非常重要。對于內參,生工生物的miRNA加尾法首先鏈cDNA合成試劑盒(B532451)中內置了內參U6的正向引物,使用該引物與通用引物R即可進行內參U6的擴增。逆轉錄酶通常具有多種活性,如逆轉錄活性、復制活性與RNA酶H活性。武漢快速逆轉錄哪家專業(yè)
逆轉錄過程的揭示是分子生物學研究中的重大發(fā)現,是對中心法則的重要修正和補充。重慶一體化逆轉錄蛋白檢測
加尾法逆轉錄的較大特點在于:對于抽提純化的miRNA,進行無差別加尾。因此,如果用戶需要對樣本中的多個miRNA進行考察,一次逆轉錄即可完成對所有qPCR模板的制備。qPCR引物方面,miRNA以及內參的反向引物都是通用引物R,不同的只是正向引物。因此在設計加尾法miRNA的qPCR引物時,只需設計特異性正向引物即可,正向引物的特異性直接決定了實驗結果的好壞??傊?,加尾法適合對樣本中多個miRNA的快速檢測。引物設計簡單,但有非特異性的風險。由于其特殊的加PolyA機制,因此miRNA加尾法逆轉錄是無法只通過常規(guī)的mRNA逆轉錄試劑盒完成的。重慶一體化逆轉錄蛋白檢測