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成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測

來源: 發(fā)布時間:2023-08-07

逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。逆轉錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測

miRNA加尾法逆轉錄:miRNA,即microRNA,是一類非常短的RNA分子,只有幾十到幾百個核首酸,在正常細胞存活期間會產(chǎn)生大量的miRNA。miRNA起著重要的抑制作用,它可以抑制特定mRNA的表達以及細胞中內(nèi)含物翻譯和轉錄等功能他們是催化機制,負責影響細胞及其產(chǎn)物的生物學復雜性和穩(wěn)定性,對于宿主機體影響是非常重要的。miRNA加尾法是一種獲得miRNA及其前體的研究方法之。較重要的是,它是RNA千擾技術的一個重要組成部分。過去的研究發(fā)現(xiàn),通過miRNA加尾法獲得的新miRNA表達調(diào)節(jié)了細胞信號傳導、細胞分裂和細胞凋亡等多重信號傳遞通路,其過程非常復雜。成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測逆轉錄實驗過程需適當?shù)腞NA質(zhì)量,過少或質(zhì)量不佳將影響擴增效果。

miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個核苷酸,因此使用隨機引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機結合到mRNA的各位置進行逆轉錄。由于qPCR的過程只需擴增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機引物的逆轉錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉錄。這種逆轉錄引物在擴增cDNA全長時是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進行逆轉錄。

逆轉錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉錄酶的選擇,逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。多逆轉錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。逆轉錄是2代測序、單細胞測序等技術的前置步驟。

逆轉錄酶(M-MLV)從MoloneyMurineLeukemiaVirus分離出來,可用于合成首先鏈cDNA、制作cDNA探針、RNA轉錄、測序和RNA的逆轉錄反應。本酶是通過點突變使RNaseH活性缺失,所以它具有的DNA聚合酶的活性與野生型相同,同時其延伸能力也有明顯提高。逆轉錄酶(M-MLV)一個活性單位定義為在37℃,10min條件下,使1nmol的脫氧核糖核酸摻入酸性沉淀物質(zhì)所需的酶量。逆轉錄酶的三個功能:1、RNA為模板指導的DNA聚合酶活性;2、DNA為模板指導的DNA聚合酶活性;3、RNaseh活性。逆轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測

逆轉錄過程是病毒的復制形式之一,如RNA病毒中的逆轉錄病毒。成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測

大多數(shù)逆轉錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為賴氨酸的tRNA,在引物tRNA3'-末端以5'→3'方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5'端水解掉RNA分子。③DNA指導的DNA聚合酶活性;以反轉錄合成的首先條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。成都cDNA合成反轉錄蛋白檢測

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