RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉(zhuǎn)錄之前還需要對(duì)RNA濃度進(jìn)行測(cè)定。一般反轉(zhuǎn)錄試劑盒會(huì)對(duì)上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過這個(gè)范圍,會(huì)使反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物產(chǎn)生偏好性(表達(dá)豐度高的基因優(yōu)先被反轉(zhuǎn)錄)而造成定量結(jié)果不準(zhǔn)確。逆轉(zhuǎn)錄引物的選擇:逆轉(zhuǎn)錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機(jī)引物和特異性引物。對(duì)于短的且不具備發(fā)卡結(jié)構(gòu)的真核細(xì)胞mRNA,三種都可用。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的發(fā)展使RNA研究得到極大便利。天津帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長(zhǎng),其長(zhǎng)度通常在幾百至幾千個(gè)核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長(zhǎng)時(shí)是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。深圳快速逆轉(zhuǎn)錄生產(chǎn)商逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中需要考慮RNA模板質(zhì)量和RNA純化的方法。
逆轉(zhuǎn)錄試劑是一類普遍應(yīng)用于生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的試劑,它們可以用于逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)操作。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)是將RNA轉(zhuǎn)錄成DNA的過程,與正常的DNA轉(zhuǎn)錄成RNA的過程相反。逆轉(zhuǎn)錄試劑可以促進(jìn)這個(gè)過程的進(jìn)行,從而使得研究人員能夠更好地了解RNA的結(jié)構(gòu)和功能。逆轉(zhuǎn)錄試劑通常由逆轉(zhuǎn)錄酶、緩沖液和酶的輔助因子組成。逆轉(zhuǎn)錄酶是一種酶類蛋白質(zhì),它可以在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中起到關(guān)鍵的作用。緩沖液的主要作用是維持反應(yīng)體系的PH值和離子強(qiáng)度,從而保證逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的順利進(jìn)行。酶的輔助因子(如酶抑制劑)則可以幫助研究人員減少誤差和提高實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性。
miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長(zhǎng)度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長(zhǎng)甚至有余,反向引物就無處安放了。那么如何實(shí)現(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長(zhǎng)度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:但其對(duì)RNA的完整度和二級(jí)結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機(jī)引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。
人體中也有逆轉(zhuǎn)錄過程,比如端粒的復(fù)制。端粒(telomere)是染色體末端的特殊結(jié)構(gòu),由重復(fù)的DNA序列(TTAGGG)和核的蛋白組成,可以保護(hù)染色體末端,維持基因組完整性。端粒的末端是單鏈3'末端,形成一種緊湊的T環(huán)結(jié)構(gòu),可保持其穩(wěn)定性。其表面覆蓋著Shelterin復(fù)合物,包括TRF1(端粒重復(fù)結(jié)合因子1)、TRF2(端粒重復(fù)結(jié)合因子2)、TIN2(TRF1相互作用核的蛋白2)、RAP1(rif相關(guān)蛋白)、POT1(端粒保護(hù))和TPP1(端粒保護(hù)蛋白1)成功將人表皮干細(xì)胞體外分離培養(yǎng)的基礎(chǔ)上,對(duì)比觀察不同發(fā)育階段人表皮干細(xì)胞端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶表達(dá)的差異特征,結(jié)果表明人胚胎、少兒、成人皮膚來源的表皮干細(xì)胞均有端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶表達(dá),其表達(dá)強(qiáng)度依次減弱。提示誘導(dǎo)和增強(qiáng)端粒酶反轉(zhuǎn)錄酶的表達(dá)對(duì)維持表皮干細(xì)胞在體外自我更新和增殖能力可能具有重要意義。高效的逆轉(zhuǎn)錄體系可提高反應(yīng)效率和檢測(cè)靈敏度。北京miQP2逆轉(zhuǎn)錄生產(chǎn)廠家
逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)要使用高質(zhì)量的反轉(zhuǎn)錄酶和逆轉(zhuǎn)錄引物,避免引物交叉污染。天津帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
逆轉(zhuǎn)錄引物:加尾法逆轉(zhuǎn)錄引物的結(jié)構(gòu)并不是想象中那么簡(jiǎn)單的oligodT,其包含三個(gè)關(guān)鍵結(jié)構(gòu):①為了與PolyA序列互補(bǔ)配對(duì),OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR過程中反向引物與cDNA的結(jié)合。③OligodT序列的3端存在一個(gè)或兩個(gè)錨定堿基,V或者VN。(兼并堿基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一種)。如果沒有錨定堿基,逆轉(zhuǎn)錄引物中的OligodT就會(huì)隨機(jī)結(jié)合到PolyA的任意位置,這樣會(huì)造成同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度不一,給較后的熔解曲線檢測(cè)帶來麻煩。因此,錨定堿基的作用就是特異性地結(jié)合到miRNA上,從而讓逆轉(zhuǎn)錄引物結(jié)合到緊挨著miRNA的那段PolyA序列上。只有這樣,才能夠保證同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物大小相同。天津帶gDNA Remover反轉(zhuǎn)錄
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