RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)：去除基因組DNA污染：殘留的基因組DNA(gDNA)會(huì)對(duì)熒光定量結(jié)果造成很大的干擾，為了使結(jié)果更加的真實(shí)、可重復(fù)，我們需要去除gDNA干擾。我們可以在引物設(shè)計(jì)時(shí)避免gDNA的擴(kuò)增，比如將上下游引物分別設(shè)在不同的外顯子上；或者在提取RNA后使用DNaseI處理以除去gDNA。較后，我們還有非常法寶，選擇一款具有g(shù)DNA去除功能的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒，一步到位去除gDNA，省心省力max。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)：逆轉(zhuǎn)錄酶熱穩(wěn)定性：逆轉(zhuǎn)錄酶在整個(gè)反轉(zhuǎn)錄體系中具有關(guān)鍵性影響。除了活性以外，逆轉(zhuǎn)錄酶的熱穩(wěn)定性同樣很重要，在較高溫度下進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄，能夠減少RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)，增加逆轉(zhuǎn)錄的效率。野生型的M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶很“怕熱”，高于37℃時(shí)，穩(wěn)定性大幅下降。酵母菌逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄酶家族中的一個(gè)重要表示。逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算

miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法：首先需要進(jìn)行RNA樣品制備，可選的方法有：離心柱法抽提（不必去除gDNA）；傳統(tǒng)Trizol法抽提（需要去除gDNA）。miRNA正向引物：需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定，正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管，根據(jù)所得每組RNA的濃度C，每孔加入1000ng總RNA，按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說(shuō)明，依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑：加樣結(jié)束后，移液器吹打混勻，低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi)，調(diào)整參數(shù)：37℃15min（反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)），85℃5s（反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)），4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說(shuō)明：此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物，注意相應(yīng)地調(diào)整無(wú)酶水的體積和反應(yīng)溫度。上海cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄費(fèi)用逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí)要記錄反應(yīng)體系的溫度、時(shí)間、反應(yīng)試劑的添加量等參數(shù)。

反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項(xiàng)，引物的選擇，OligodT：選擇OligodT時(shí)，要求RNA必須有PolyA，所以真核生物的mRNA都適用。適合長(zhǎng)鏈甚至全長(zhǎng)mRNA的RT，所以對(duì)RNA樣品的質(zhì)量要求較高，較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng)，建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物：特異性引物只能用你設(shè)計(jì)引物時(shí)的下游引物做RT，引物設(shè)計(jì)質(zhì)量影響RT的結(jié)果，而且不同引物退火溫度本來(lái)就不相同，所以按照說(shuō)明書按照一個(gè)溫度做不是較佳選擇，一般不推薦。

反轉(zhuǎn)錄酶的選擇：反轉(zhuǎn)錄酶（Reversetranscriptase）又稱逆轉(zhuǎn)錄酶。是以RNA為模板指導(dǎo)dNTP合成互補(bǔ)DNA（cDNA）的酶。一部分反轉(zhuǎn)錄酶具有RNA酶活性，能夠在轉(zhuǎn)錄后降解RNA-DNA雜交鏈中的RNA鏈。如果反轉(zhuǎn)錄酶沒有Rnase酶活性，可加入RNaseH來(lái)獲得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒（MMLV）反轉(zhuǎn)錄酶和禽成髓細(xì)胞瘤病毒（AMV）反轉(zhuǎn)錄酶。依據(jù)RT-PCR，理想的狀態(tài)下是選擇具有較高熱穩(wěn)定性的反轉(zhuǎn)錄酶，cDNA的合成才能在較高的溫度下進(jìn)行，確保成功轉(zhuǎn)錄具有較高二級(jí)結(jié)構(gòu)的RNA，并確保在整個(gè)反應(yīng)過(guò)程中的全部活性，從而得到質(zhì)量更高的cDNA。逆轉(zhuǎn)錄可用于新型病毒的檢測(cè)。

加尾法逆轉(zhuǎn)錄的較大特點(diǎn)在于：對(duì)于抽提純化的miRNA，進(jìn)行無(wú)差別加尾。因此，如果用戶需要對(duì)樣本中的多個(gè)miRNA進(jìn)行考察，一次逆轉(zhuǎn)錄即可完成對(duì)所有qPCR模板的制備。qPCR引物方面，miRNA以及內(nèi)參的反向引物都是通用引物R，不同的只是正向引物。因此在設(shè)計(jì)加尾法miRNA的qPCR引物時(shí)，只需設(shè)計(jì)特異性正向引物即可，正向引物的特異性直接決定了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的好壞。總之，加尾法適合對(duì)樣本中多個(gè)miRNA的快速檢測(cè)。引物設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單，但有非特異性的風(fēng)險(xiǎn)。由于其特殊的加PolyA機(jī)制，因此miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄是無(wú)法只通過(guò)常規(guī)的mRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒完成的。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前應(yīng)反復(fù)檢查所有試劑盒的有效期和使用條件。北京彩色逆轉(zhuǎn)錄混合報(bào)價(jià)

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)盡量避免多次凍融處理RNA樣品，避免樣品質(zhì)量下降。逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算

逆轉(zhuǎn)錄是指以RNA為模板合成DNA的過(guò)程，即將遺傳信息由RNA逆向傳給DNA的過(guò)程，其遺傳的傳遞方向與轉(zhuǎn)錄相反。反轉(zhuǎn)錄酶也可寫成逆轉(zhuǎn)錄酶又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA（cDNA）的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性；以RNA為模板，催化dNTP聚合成DNA的過(guò)程。此酶需要RNA為引物，多為色氨酸的tRNA，在引物tRNA3′－末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性，因此沒有校正功能，所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。逆轉(zhuǎn)錄酶哪家劃算

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