反轉(zhuǎn)錄酶的注意事項，引物的選擇，OligodT：選擇OligodT時，要求RNA必須有PolyA，所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT，所以對RNA樣品的質(zhì)量要求較高，較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應(yīng)，建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。特異性引物：特異性引物只能用你設(shè)計引物時的下游引物做RT，引物設(shè)計質(zhì)量影響RT的結(jié)果，而且不同引物退火溫度本來就不相同，所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇，一般不推薦。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中要使用干燥無菌的管頭和標本采集器避免受外界污染。揚州一步法逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄的過程：生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過程就比較復雜，比如逆轉(zhuǎn)錄病毒（retrovirus）。病毒是真正的“極簡風”，所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中，經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu)，充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發(fā)酶來合成引物，它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA，在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間，所以首先次只能合成出一部分cDNA，然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列，“跳”回另一端，完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時候，會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過一次跳躍（jump），以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列，稱為長末端重復（longterminalrepeats，LTR）。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列，還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結(jié)構(gòu)。揚州一步法逆轉(zhuǎn)錄混合逆轉(zhuǎn)錄也可作為RNA表達譜的分析方法。

逆轉(zhuǎn)錄酶是存在于RNA病毒體內(nèi)的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實驗中的逆轉(zhuǎn)錄酶需要具有以下二種活性：依賴RNA的DNA聚合酶活性：以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性：以一條DNA鏈為模板合成互補的雙鏈DNA。在選擇逆轉(zhuǎn)錄酶時，建議選擇無RNaseH①活性（RNaseH-）的逆轉(zhuǎn)錄酶。具有RNaseH活性的逆轉(zhuǎn)錄酶的RNaseH活性會與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物（或cDNA延伸鏈）形成的雜合鏈，并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物，降低了cDNA合成的產(chǎn)量與長度。

多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性，DNA指導的DNA聚合酶活性；以反轉(zhuǎn)錄合成的首先條DNA單鏈為模板，以dNTP為底物，再合成第二條DNA分子。除此之外，有些反轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性，這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用，目前它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板，在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下，合成出互補的DNA(cDNA)，由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNalibrary)，從中篩選特異的目的基因，這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。逆轉(zhuǎn)錄實驗過程需適當?shù)腞NA質(zhì)量，過少或質(zhì)量不佳將影響擴增效果。

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR，miRNA與mRNA不同，成熟的miRNA的長度只有20nt左右，非常短，通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余，反向引物就無處安放了。那么如何實現(xiàn)miRNA的qPCR擴增呢？解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度。普遍的方法有兩種，加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后，得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上，這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項：選擇合適的引物：但其對RNA的完整度和二級結(jié)構(gòu)的要求較高，而且不適用于原核生物。隨機引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上，包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉(zhuǎn)錄后的DNA可直接用于基因克隆或測序等應(yīng)用。杭州快速逆轉(zhuǎn)錄試劑測序

逆轉(zhuǎn)錄可改變RNA的信息內(nèi)容，為研究RNA功能提供基礎(chǔ)。揚州一步法逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄實驗步驟：用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進行RT（20ul體積）1、準備0、65ml的EP管。2、冰上操作：在EP管中加入10ulDEPC水，1ul引物，1ul模板RNA，1uldNTP，短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后，立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后，冰上操作：加入4ul5×First-StrandBuffer，1ul0.1MDTT，1ulRNAseInhibitor，1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、－20℃保存，或立即進行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers，使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個區(qū)域起始，并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率，較大程度保證qPCR結(jié)果的真實性和可重復性。揚州一步法逆轉(zhuǎn)錄混合

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