逆轉(zhuǎn)錄PCR的用途普遍,可用于分析基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物、檢測細胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探針、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在臨床上RT-PCR可以用于遺傳病診斷、病癥檢測、檢測病人標本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究環(huán)境脅迫對植物基因表達的影響,以及在特定的環(huán)境或生長階段中植物體不同部位基因表達的差異性。使用RT-PCR檢測分析RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物具有以下突出的優(yōu)點:理論上可以檢測幾乎任何基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物;可以實現(xiàn)極為微量RNA樣品(ng級別)的檢測;樣品耐受性好,未經(jīng)純化的粗制生物樣品也可以用于檢測。逆轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)條件和反應(yīng)體系的優(yōu)化十分重要。重慶彩色反轉(zhuǎn)錄純度高
逆轉(zhuǎn)錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉(zhuǎn)錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉(zhuǎn)錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活A(yù)MV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉(zhuǎn)錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。寧波快速逆轉(zhuǎn)錄混合逆轉(zhuǎn)錄后的DNA可直接用于基因克隆或測序等應(yīng)用。
逆轉(zhuǎn)錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉(zhuǎn)錄酶的選擇,逆轉(zhuǎn)錄實驗前要對反應(yīng)體系進行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對照。多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。
RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:防止RNA模板的降解:毫無疑問,RNA質(zhì)量對cDNA合成結(jié)果會產(chǎn)生重要影響。但RNA很脆弱,易于降解。為了保證RNA的完整性,我們需要小心又小心,比如在冰上操作,用RNase-free的頭頭和離心管,減少操作時間等。在反應(yīng)體系中加入RNase抑制劑也能有效防止RNA降解。另外,建議在進行逆轉(zhuǎn)錄前,通過瓊脂糖凝膠電泳檢查RNA條帶的質(zhì)量。通常完整的真核RNA應(yīng)包括28S、18S條帶,且28S條帶強度一般是18S的兩倍左右。RNA逆轉(zhuǎn)錄實驗注意事項:選擇合適的引物:OligodT引物和隨機引物都能進行逆轉(zhuǎn)錄。OligodT引物只能與mRNA的3’端poly(A)結(jié)合,沒有rRNA和tRNA的干擾,特異性強。逆轉(zhuǎn)錄實驗要使用高質(zhì)量的反轉(zhuǎn)錄酶和逆轉(zhuǎn)錄引物,避免引物交叉污染。
多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以反轉(zhuǎn)錄合成的首先條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。除此之外,有些反轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,目前它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的DNA(cDNA),由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNalibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。深圳加尾法逆轉(zhuǎn)錄哪家好
逆轉(zhuǎn)錄實驗在反應(yīng)前應(yīng)將各反應(yīng)試劑混勻,避免試劑沉淀或剪切。重慶彩色反轉(zhuǎn)錄純度高
逆轉(zhuǎn)錄酶還有DNA內(nèi)切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關(guān)。逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)對于遺傳工程技術(shù)起了很大的推動作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,由此可構(gòu)建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉(zhuǎn)錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導(dǎo)的DNA合成過程。病毒復(fù)制方式:逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉(zhuǎn)錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。重慶彩色反轉(zhuǎn)錄純度高
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