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山西空間轉(zhuǎn)錄組價(jià)格

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-24

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今前沿的科研技術(shù),相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱“歐易生物”)主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)培訓(xùn)班”落下帷幕。培訓(xùn)中,歐易講師團(tuán)隊(duì)以其豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)及專業(yè)的生信能力,從空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程、測(cè)序原理、實(shí)驗(yàn)實(shí)操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度,向遠(yuǎn)道而來(lái)的學(xué)員們展開(kāi)了系統(tǒng)性的培訓(xùn)。


Science發(fā)表了將組織擴(kuò)展和原位RNA測(cè)序結(jié)合起來(lái)的新型空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)ExSeq。山西空間轉(zhuǎn)錄組價(jià)格

轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過(guò)在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來(lái)獲取,目前已有多種技術(shù)策略被開(kāi)發(fā)報(bào)道, 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)(Spatial Transcriptomics,ST)和 Visium 技術(shù),通過(guò)將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標(biāo)簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上,來(lái)捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本,并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達(dá)及位置信息。一些無(wú)需成像即可計(jì)算重建空間基因表達(dá)模式所需信息的技術(shù)也被開(kāi)發(fā)了出來(lái),其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù),它記錄 cDNA 之間的接近度,該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對(duì)位置。河南10x空間轉(zhuǎn)錄組空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失。

空間轉(zhuǎn)錄組是在組織原位檢測(cè)基因表達(dá)的一種技術(shù),與bulk RNA-seq或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相比,空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失,使得我們?cè)跈z測(cè)基因表達(dá)的同時(shí)獲得基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。正是由于空間轉(zhuǎn)錄組可以從多維度解析生物學(xué)過(guò)程的特點(diǎn),近年來(lái)關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組無(wú)論是在技術(shù)開(kāi)發(fā),還是大規(guī)模應(yīng)用或商業(yè)化,都得到蓬勃發(fā)展。例如2019年4月,Science發(fā)文通過(guò)空間轉(zhuǎn)錄組揭示ALS(肌萎縮側(cè)索硬化癥,又稱漸凍癥)分子病理的時(shí)空動(dòng)態(tài);2019年8月,Nature在線發(fā)表了景乃禾團(tuán)隊(duì)解析小鼠早期胚胎細(xì)胞的時(shí)空表達(dá)數(shù)據(jù);2020年9月,Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉(zhuǎn)錄組解析人鱗狀細(xì)胞*的文章;2021年1月,Science發(fā)表了將組織擴(kuò)展和原位RNA測(cè)序結(jié)合起來(lái)的新型空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)ExSeq;2021年4月,10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化解決方案。

當(dāng)前的技術(shù)主要有四種策略:1、基于組學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)合空間重建的計(jì)算策略。這種計(jì)算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達(dá)模式或共表達(dá)的趨勢(shì),從單個(gè)細(xì)胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細(xì)胞間的環(huán)境。然而,這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢(shì)或特定組織的總體布局。2、激光切割與NGS測(cè)序結(jié)合的策略?;贚CM的轉(zhuǎn)錄組學(xué)或基因組學(xué)成功地獲得了單個(gè)細(xì)胞的空間轉(zhuǎn)錄組,盡管其通量很低,但是在可以標(biāo)記成千上萬(wàn)個(gè)單個(gè)細(xì)胞位置的多路復(fù)用條形碼策略可行之前,將少量細(xì)胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中,可能具有一定價(jià)值。3、基于熒光物質(zhì)原位的轉(zhuǎn)錄組學(xué)。基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)在很大程度上增加了可檢測(cè)區(qū)域,但也存在一些問(wèn)題,例如幾種smFISH方法很難從包括信號(hào)干擾、轉(zhuǎn)錄本積累等復(fù)雜背景中提取單個(gè)細(xì)胞。4、基于寡核苷酸的空間條碼加上NGS測(cè)序。費(fèi)用較高且無(wú)法在單個(gè)細(xì)胞中獲得轉(zhuǎn)錄組??臻g轉(zhuǎn)錄組的組學(xué)板塊包括cDNA的合成、擴(kuò)增、接頭連接和測(cè)序,記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息 。

空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí),多方位測(cè)量轉(zhuǎn)錄組譜。然而,現(xiàn)有的分析方法并沒(méi)有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問(wèn)題。來(lái)自美國(guó)的科研團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了BayesSpace,這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法,它使用來(lái)自空間鄰域的信息來(lái)增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析。BayeSpace通過(guò)使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入,無(wú)縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中,輸出同樣存儲(chǔ)在SingleCellExperiment對(duì)象中,該對(duì)象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。空間轉(zhuǎn)錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術(shù),從而解析單個(gè)組織切片中的所有mRNA。湖北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組多少錢

早期空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的另一條發(fā)展路線是基因捕獲和增強(qiáng)子捕獲篩選。山西空間轉(zhuǎn)錄組價(jià)格

10xVisium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理為將新鮮冷凍的組織切片,置于文庫(kù)制備載玻片上,經(jīng)過(guò)固定、染色和透化后,釋放出mRNA,mRNA與空間條形碼捕獲探針相結(jié)合,從而捕獲基因表達(dá)信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序,并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化分析??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今**前沿的科研技術(shù),相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。山西空間轉(zhuǎn)錄組價(jià)格

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè),技術(shù)力量雄厚。公司是一家私營(yíng)合伙企業(yè)企業(yè),以誠(chéng)信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神、專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)、踏實(shí)的職工隊(duì)伍,努力為廣大用戶提供***的產(chǎn)品。公司業(yè)務(wù)涵蓋科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。歐易生物自成立以來(lái),一直堅(jiān)持走正規(guī)化、專業(yè)化路線,得到了廣大客戶及社會(huì)各界的普遍認(rèn)可與大力支持。