空間代謝組學:中文標題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象:小鼠發(fā)表期刊:CellMetabolism影響因子:27.287合作單位:斯坦福大學運用生物技術:空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因,在細胞增殖、凋亡、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用,其易位、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關。近年來關于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多,據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關酶密切相關;致*基因MYC刺激細胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細胞膜,但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導的**中脂質(zhì)生成的機制。空間代謝組學一個樣本多少錢。遼寧空間代謝組學藥代動力學
空間代謝組學主要從事質(zhì)譜成像新技術、空間分辨代謝組學新方法及其在生物醫(yī)藥應用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來在質(zhì)譜成像空間分辨代謝組學領域取得重要突破,并**國際前沿發(fā)展。目前,承擔著國家自然科學基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項課題,科研經(jīng)費充足;擁有先進的液質(zhì)聯(lián)用儀器和質(zhì)譜成像儀器數(shù)臺,建立了新藥研發(fā)質(zhì)量管理規(guī)范體系,實驗條件完備。具有分析化學、或藥物分析、或生物學等相關專業(yè)的博士學位。2、具有以下研究經(jīng)驗或能力之一:質(zhì)譜分析;代謝組學研究;與新藥或疾病相關的分子生物學研究;生物信息學等。河北空間代謝組學在醫(yī)藥應用代謝組學分析、空間轉(zhuǎn)錄組測序價格、代謝組學分析。
鹿明生物空間代謝組學項目實測結(jié)果1、可實現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子。空間多組學聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項目10+??臻g多組學檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點的一個代表性質(zhì)譜圖,在該圖中可以觀察到數(shù)千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復雜性高度一致。實驗結(jié)果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da,同一物質(zhì)的檢測動態(tài)范圍高達1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強度范圍從0到104甚至到106??臻g代謝組性價比高.擁有專業(yè)技術團隊。
1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡信息。大腦中復雜網(wǎng)絡可視化使用Cyctoscope軟件完成??臻g代謝組學研究應用前景廣闊。湖南空間代謝組學翻譯
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空間代謝組學:a)小鼠腦冠狀切片圖像顯示亮場圖像和拉曼光譜圖像(b)脂質(zhì),蛋白質(zhì)和DNA的拉曼光譜覆蓋層(c)髓鞘結(jié)合蛋白(MBP)、Tuj1(III類β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大腦感興趣區(qū)域的高分辨率顯微拉曼圖像(200×200μm),顯示與脂類(2885cm?1)、蛋白質(zhì)(2940cm?1)和DNA(3000cm?1)相關的拉曼光譜峰(e)K-means聚類(n=2個聚類)顯示不同的腦組織特征(f)與twok-means團簇相關的**平均拉曼光譜(g)根據(jù)m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空間代謝組成像顯示灰質(zhì)和白質(zhì)分離,推測為Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(h)灰質(zhì)和白質(zhì)的代表性的平均空間代謝質(zhì)譜圖(分別以綠色和紅色表示) 遼寧空間代謝組學藥代動力學
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