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上海代謝組學和腸道菌群相關分析

來源: 發(fā)布時間:2022-09-23

非靶代謝組學研究:2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院消化內科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通過采用非靶代謝組學和基因表達芯片,發(fā)現(xiàn)了適應酸性微環(huán)境的胰腺導管腺* (PDAC)細胞具有更強的轉移和增殖能力。


代謝組學顯示適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞中葡萄糖增加、糖酵解減少,而轉錄組學發(fā)現(xiàn)適應酸性微環(huán)境細胞中的差異表達基因主要為細胞外基質修飾和 Hippo 信號傳導相關基因。MMP1 在在適應酸性微環(huán)境細胞中上調**為明顯,實驗驗證了其由 YAP/TAZ 通路介導,而被 AMPK抑制。該研究確認了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞的增殖和轉移。 讀懂代謝組學 代謝組學的研究范疇。上海代謝組學和腸道菌群相關分析

土壤代謝組學:銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導致顆粒在土壤中積累,并對環(huán)境造成未知風險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當前有關NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對土壤生物化學的變化提出合理假設。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學方法,研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響。浙江代謝組學數(shù)據(jù)庫代謝組學多年質譜組學系統(tǒng)研究經(jīng)驗。

糞便代謝組分析,中文標題:二烯丙基二硫化物(DADS)通過調節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象:小鼠糞便發(fā)表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子:5.293發(fā)表時間:2022年1月7日合作單位:復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科運用生物技術:糞便代謝組分析(由鹿明生物提供技術支持)、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導的腸道白色念珠菌小鼠模型,模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結腸炎的嚴重程度,另一方面通過微生物組學和代謝組學等手段確認了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(改變腸道微生物群和代謝物)、腸道通透性和全身炎癥反應。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。

糞便LC-MS代謝組學研究方法,2022年,復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***,并改變了小鼠腸道微生物群落結構和代謝特征,探究了DADS可以調節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內在機理,為***白色念珠菌***提供了理論依據(jù)。對生物體內所有代謝物進行定量分析-代謝組學。

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法:2021年10月,廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝,丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達的代謝物被下調,表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環(huán)境產(chǎn)生的風險提供了新的見解。空間代謝組學 代謝組學測序原理 代謝組學研究價格。江蘇代謝組學 平臺

代謝組學行業(yè)解決方案和技術服務流程。上海代謝組學和腸道菌群相關分析

代謝組學+轉錄組學,中文標題:基于代謝組學分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對斑馬魚胚胎和仔魚的健康風險研究對象:斑馬魚胚胎和仔魚發(fā)表期刊:JournalofHazardousMaterials影響因子:10.588運用生物技術:代謝組學環(huán)境毒理學浙江省農科院農產(chǎn)品質量營養(yǎng)所風險評估研究團隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學在農藥聯(lián)合暴露效應機制研究中取得新進展,作者:楊桂玲,王彥華,李健,王豆,鮑志偉,王強(通訊作者),靳遠詳(共同通訊作者),在JournalofHazardousMaterials期刊發(fā)表的文章,通過代謝組學+轉錄組學的多組學整合分析技術來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復雜病理生理和毒性通路。研究認為獲得的數(shù)據(jù)可以為不同類型殺菌劑及其混合物對水生生物的毒性提供理論依據(jù)。上海代謝組學和腸道菌群相關分析

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