本研究采用串聯(lián)質量標簽(TMT)標記的蛋白質組學和平行反應監(jiān)測(PRM)技術,對蓮子脫水過程中的生理調控網絡進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調控網絡提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。歐易鹿明生物蛋白質研究技術。福建蛋白組學與代謝組學
隨著質譜技術的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質組研究推進到全新的“4D蛋白質組”層面,打破了基于質譜的蛋白質組學研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質組學在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學結果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉化組學應用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠實現(xiàn)少量細胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質組學分析,在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。福建蛋白組學 武漢公司扎根蛋白組學臨床科研基礎研究領域,多年項目服務經驗。
在本研究中,利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發(fā)育過程中,轉錄本和蛋白質組之間存在相當大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關鍵時期:在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值,同時種仁內部大部分營養(yǎng)物質開始迅速積累。通過轉錄組數據和蛋白質組數據綜合分析油脂合成的調控網絡,乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。
TMTpro-16plex等標記試劑已經發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復、3組6重復的實驗設計,16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質譜儀平臺的蛋白組學近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標記策略也被廣泛應用于多重定量蛋白質組學中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標記蛋白組,18個樣本以內,可實現(xiàn)一次標記和分級,避免了多批次標記引入的批次效應,能***提升樣本的數據質量。同時對更多蛋白質鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個技術可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術。蛋白質組學,蛋白質組分析,專業(yè)的多組學聯(lián)合分析。
采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析,共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析,結果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中,198個(32%)和198個(26%)蛋白質豐度增加,而420個(68%)和558個(74%)蛋白質豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個蛋白質的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。蛋白質組學的特點蛋白質組和蛋白質組學的概念。福建蛋白組學與代謝組學
單細胞組學 單細胞蛋白組學 蛋白質組學 。福建蛋白組學與代謝組學
2021年10月,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質蛋白表達下調,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據。其中轉錄組學和蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持。福建蛋白組學與代謝組學
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司是一家檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業(yè)管理咨詢。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。歐易生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。歐易生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。歐易生物始終關注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。