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作者進行了綜合分析，將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中，并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來預(yù)測DKD狀態(tài)。五種機器學(xué)習(xí)模型表明，組合模型提高了DKD預(yù)測的準(zhǔn)確性...

通過酵母雙雜交進行篩選，結(jié)果顯示 SWC6 可以在藍(lán)光下與 CRY1 相互作用（圖 A-C）。同樣，酵母雙雜交實驗顯示 CRY2 也可以在藍(lán)光下與 SWC6 相互作用（圖 D）。并通過 pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull...

展示了空間代謝組成像技術(shù)的應(yīng)用。這一分析***表明脫髓鞘后新形成的髓鞘具有與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。因此，這種HSL方法學(xué)可能**提高目前對多發(fā)性硬化癥再髓鞘形成的理解，并可能為多發(fā)性硬化癥研究中評估再髓鞘形成***提供一種新的策略。此外，HSL方法可以針對*...

通過蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征，探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用，為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依...

作者進行了空間代謝組學(xué)(～50μm的空間分辨率)，并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標(biāo)志物進行了成像，推測它們分別屬于Cer(D18：1/24：1)和PC(38：6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明，使用拉曼光譜結(jié)...

文章使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法，分析鑒定了差異表達(dá)的蛋白質(zhì)，對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體論(GO)分析，顯示下調(diào)參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細(xì)胞內(nèi)銅水平的SOX2/OCT4+細(xì)胞中的線粒體ETC途徑。確定TM...

酵母文庫：近日，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物育種栽培研究所儲黃偉副研究員、曹黎明研究員為共同通訊作者，在Plant，Cell&Environment雜志（IF：7.228）在線發(fā)表了題為“Aconservedclathrin-coatedvesiclecomponen...

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題：氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.2...

DIA蛋白組學(xué)：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學(xué)課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPH...

非靶代謝組學(xué)研究：2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phospha...

2022年2月，亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Erik C. B. Johnson課題組在Nature neuroscience發(fā)表了題為 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease ...

酵母文庫實驗：本研究發(fā)現(xiàn)了一個硝酸鹽響應(yīng)的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2，它參與調(diào)節(jié)硝酸鹽介導(dǎo)的蘋果植株生長。利用酵母雙雜交、蛋白質(zhì) pull-down、BiFC 實驗證實，MdBT2 可以與一個 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作，這種互作是 MdR...

進行了酵母雙雜交文庫的篩選，結(jié)果顯示鈣依賴的種子特異性蛋白激酶SPK可以與OsNF-YB9相互作用，分段截取互作驗證顯示OsNF-YB9的N端是互作所必須的（圖a-b），并通過雙熒光分子互補實驗、BiFC、體外GST-pulldown實驗得以證實（圖c-e）。...

空間代謝組學(xué)探究MYC、SREBP1與**發(fā)生的能量機制探索。斯坦福大學(xué)Dean W. Felsher課題組在Cell Metabolism發(fā)表的題為“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Eleme...

歐易生物酵母文庫技術(shù)發(fā)表的又一篇高水平研究論文。植物***茉莉酸(JA)參與植物許多發(fā)育過程的調(diào)控。JAZ蛋白是茉莉酸信號反應(yīng)的阻遏物，通過抑制JA轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)劑來負(fù)向調(diào)節(jié)JA信號?；ㄇ嗨睾驮ㄇ嗨厥欠N子、葉、花和果實中重要的植物次生代謝產(chǎn)物，可充當(dāng)抗氧化劑，幫助...

單細(xì)胞生物學(xué)**近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領(lǐng)域中，**前沿的則是單細(xì)胞測序技術(shù)。傳統(tǒng)測序方法一次處理成千上萬個細(xì)胞，得到的變異水平也是成千上萬個細(xì)胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個細(xì)胞是完全相同的。所以，單細(xì)胞測序?qū)?..

歐易生物單細(xì)胞測序近期高分文章不斷，在接下來的幾篇單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀軟文里，我們將為大家持續(xù)送上近期合作發(fā)表的單細(xì)胞文獻(xiàn)解讀。本篇文章為大家解讀今年5月由上海交通大學(xué)附屬上海市第一人民醫(yī)院劉堃團隊在Diabetes(IF9.461)期刊發(fā)表的關(guān)于2型糖尿病小鼠...

2021年3月30日，暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院舉行了“單細(xì)胞聯(lián)合實驗室”的簽約儀式。簽約儀式由暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院院長尹芝南教授主持，生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院郝健磊副研究員、上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司營銷副總經(jīng)理董棟先生和單細(xì)胞事業(yè)部總經(jīng)理張志明先生等人出...

細(xì)胞是生命活動的基本功能單位。不同類型細(xì)胞之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成了生命的基礎(chǔ)。研究對象的這一“基本屬性”決定了單細(xì)胞高通量技術(shù)是目前我們解析各種生命現(xiàn)象、揭示各種生物學(xué)機制的**強有力的技術(shù)手段。隨著單細(xì)胞測序技術(shù)的發(fā)展，原核細(xì)胞的scRNA-seq技術(shù)也...

食管鱗狀細(xì)胞* (ESCC) 占全世界食管*病例的90%。雖然新輔助化療 (NACT-ESCC) 提高了ESCC患者的生存率，但患者的5年生存率仍然較低，約13.9%的ESCC患者在接受NACT聯(lián)合手術(shù)方案后出現(xiàn)復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)端***轉(zhuǎn)移，表明ESCC復(fù)雜性。因此，...

單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細(xì)胞 RNA 含量很少，擴增和捕獲效率的微小變化，就可能在細(xì)胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本，可能會因為純粹的技術(shù)原因而不盡相同，矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處...

歐易單細(xì)胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院王群教授團隊在EBioMedicine（IF8.143）期刊發(fā)表的關(guān)于食管鱗狀細(xì)胞*（ESCC）分子圖譜的相關(guān)成果，對食管鱗狀細(xì)胞*的異質(zhì)性和**微環(huán)境進行深入的分析并提出了食管鱗狀細(xì)胞**...

目前已在動物組織單細(xì)胞測序中有所應(yīng)用，那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測序中呢？雖然植物和動物都是生物組織，但在物種生理特性、理化特性上都有極大的差異，適用于動物細(xì)胞的方法并不一定能簡單適用于植物原生質(zhì)體?；谶@種想法及想解決問題的決心，我...

目前已在動物組織單細(xì)胞測序中有所應(yīng)用，那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測序中呢？雖然植物和動物都是生物組織，但在物種生理特性、理化特性上都有極大的差異，適用于動物細(xì)胞的方法并不一定能簡單適用于植物原生質(zhì)體。基于這種想法及想解決問題的決心，我...

單細(xì)胞RNA-seq能夠**地提供每個細(xì)胞的RNA表達(dá)譜，并鑒定異質(zhì)細(xì)胞群中的稀有細(xì)胞。盡管**異質(zhì)性可歸因于累積突變，但即使是遺傳上相同的細(xì)胞在相同環(huán)境下也可能表現(xiàn)出基因和蛋白表達(dá)水平的差異，從而導(dǎo)致耐藥性的產(chǎn)生。單細(xì)胞RNA-seq就能夠發(fā)現(xiàn)這些稀有個體。...

inferCNV 是一款 R 包，用來探索**單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中體細(xì)胞大規(guī)模染色體拷貝數(shù)變異，例如整個染色體或大片段染色體的擴增（gain）或缺失（loss）。通過與一組參考的“正?！奔?xì)胞比較，探索**基因組不同位置的基因表達(dá)強度來實現(xiàn)。通過熱圖顯示每條染色...

單細(xì)胞測序的作用：一、在傳統(tǒng)的研究方法中，我們往往根據(jù)標(biāo)記基因和細(xì)胞形態(tài)來區(qū)分不同細(xì)胞類型，而這種方法無可厚非的存在很多爭議。而單細(xì)胞測序技術(shù)可以更精細(xì)無偏倚的來對細(xì)胞進行分群。尤其是對免疫學(xué)，**學(xué)，遺傳學(xué)的研究將會帶來巨大影響。二、分析稀有的細(xì)胞，特別是特...

肝*是全球**相關(guān)死亡的第四大原因，肝細(xì)胞*（HCC）是肝*的主要形式。目前對于肝*的***手段通常是手術(shù)切除，但較高的術(shù)后復(fù)發(fā)率降低了患者的生存率，尤其是術(shù)后 2 年內(nèi)的早期復(fù)發(fā)占整體 HCC 復(fù)發(fā)病例的 70%。本研究中作者通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序?qū)υl(fā)及早期...

GC-MS非靶向代謝組學(xué)等研究方法：2021年10月，廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response revea...

代謝組學(xué)研究：濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來，在中國白酒釀造行業(yè)中，人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質(zhì)量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學(xué)機制，以及這種變化與生產(chǎn)高質(zhì)量濃香白酒之間的聯(lián)系，本文對該釀造微生態(tài)...