代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí),數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個(gè)樣本數(shù),每一行表示一個(gè)樣品, K表示K個(gè)變量,每一列表示一個(gè)變量,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量,不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡(jiǎn)單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無(wú)法基于整體數(shù)據(jù)對(duì)所測(cè)樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析。差異倍數(shù)變化大?。‵old Change,F(xiàn)C)表示實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的含量比值,可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì)?深圳靶向代謝組學(xué)服務(wù)代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:...
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化,從中找出表達(dá)差異的代謝物,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過(guò)程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn)。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過(guò)采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實(shí)現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測(cè)和鑒...
代謝組學(xué)發(fā)展前景:代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”,每年發(fā)表的代謝組學(xué)研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速,盡管還沒(méi)有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過(guò)市場(chǎng)研究發(fā)現(xiàn),健康人并不希望進(jìn)行基因型分析,所以,對(duì)于這些人群來(lái)說(shuō),基因組學(xué)研究在臨床上的應(yīng)用很有限。而代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似,且相對(duì)于基因組學(xué)來(lái)說(shuō),提供的個(gè)人信息更少,故其在臨床上的應(yīng)用有可能產(chǎn)生一定的影響。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。哈爾濱LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)分析研究代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組...
代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見(jiàn)的樣本主要有:臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個(gè)或多個(gè)瞬時(shí)狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡(jiǎn)單”的,采集后通過(guò)低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動(dòng)。另外,不同的檢測(cè)要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請(qǐng)參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。貴州植物靶向代謝組學(xué)檢測(cè)多...
代謝組學(xué)發(fā)展前景:較低的費(fèi)用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個(gè)原因。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低,研究人員可以通過(guò)代謝組學(xué)研究篩檢出代謝產(chǎn)物,然后采用更昂貴的基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的方法對(duì)有意義的代謝產(chǎn)物進(jìn)一步加以研究。首先,必須識(shí)別出代謝產(chǎn)物,這并不是簡(jiǎn)單的工作。代謝組學(xué)研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對(duì)代謝產(chǎn)物的識(shí)別,這也是比較有趣的方面,而更具挑戰(zhàn)性的工作,是進(jìn)一步確認(rèn)所有代謝物的功能。此外,質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高,由于缺乏均勻性,使色譜分析變得更加困難,無(wú)法識(shí)別出樣品中的未知物質(zhì)。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)...
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí),數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個(gè)樣本數(shù),每一行表示一個(gè)樣品, K表示K個(gè)變量,每一列表示一個(gè)變量,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量,不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡(jiǎn)單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無(wú)法基于整體數(shù)據(jù)對(duì)所測(cè)樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析。差異倍數(shù)變化大?。‵old Change,F(xiàn)C)表示實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的含量比值,可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì)?南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)代謝組...
代謝組學(xué)發(fā)展前景:較低的費(fèi)用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個(gè)原因。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低,研究人員可以通過(guò)代謝組學(xué)研究篩檢出代謝產(chǎn)物,然后采用更昂貴的基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的方法對(duì)有意義的代謝產(chǎn)物進(jìn)一步加以研究。首先,必須識(shí)別出代謝產(chǎn)物,這并不是簡(jiǎn)單的工作。代謝組學(xué)研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對(duì)代謝產(chǎn)物的識(shí)別,這也是比較有趣的方面,而更具挑戰(zhàn)性的工作,是進(jìn)一步確認(rèn)所有代謝物的功能。此外,質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高,由于缺乏均勻性,使色譜分析變得更加困難,無(wú)法識(shí)別出樣品中的未知物質(zhì)。代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格代謝組學(xué):代謝組...
代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō),不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō),質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過(guò)去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。哈爾濱GC-MS非靶向代謝組學(xué)主...
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測(cè) (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測(cè) (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長(zhǎng)了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測(cè)的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對(duì)極為特定質(zhì)量的檢測(cè)。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對(duì)非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測(cè)和定量。代謝組學(xué)先進(jìn)分析...
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:多變量分析:多變量分析方法能同時(shí)處理數(shù)百或數(shù)千個(gè)變量,并且能處理變量之間的相互關(guān)系。利用變量之間的協(xié)方差或相關(guān)性,使原始數(shù)據(jù)在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數(shù)據(jù)中的信息。但是如果存在大量無(wú)信息變量可能會(huì)妨礙多變量分析的能力,無(wú)信息變量的數(shù)量越多,減少真陽(yáng)性數(shù)量的效果就越明顯。多變量分析分為無(wú)監(jiān)督分析方法和有監(jiān)督分析方法。在代謝組學(xué)分析中無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)有主成分分析只需要數(shù)據(jù)集X,而有監(jiān)督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析,這類方法在分析時(shí)除了需要數(shù)據(jù)集X,還需對(duì)樣品進(jìn)行指定并分組, 這樣分組后模型將自動(dòng)加上另外一個(gè)隱含的數(shù)據(jù)集Y,通常Y的...
代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過(guò)揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種病理生理過(guò)程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)的末端。以人體為例,對(duì)基因序列信息研究是基因組學(xué)的范疇。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究基因在外在或內(nèi)在環(huán)境刺激下不同的表達(dá)?;蛐畔⒎g成蛋白質(zhì)后,各種蛋白的形狀、功能、相互關(guān)系是蛋白組學(xué)的研究范疇。各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)過(guò)人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學(xué)的研究范圍。...
代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō),不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō),質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過(guò)去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。較低的費(fèi)用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個(gè)原因。杭州脂質(zhì)代謝組學(xué)多應(yīng)用GC-MS非靶向...
GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系?代謝組學(xué)是運(yùn)用多種技術(shù)手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等)的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對(duì)生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺(tái)。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因?yàn)槠漭^為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)的特點(diǎn),被大量地運(yùn)用在植物、動(dòng)物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展,運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點(diǎn)的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點(diǎn)、疾病機(jī)制研...
代謝組學(xué)研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來(lái)說(shuō),代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識(shí)別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對(duì)此進(jìn)行更深入的研究。代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些?廣東常規(guī)靶向代謝組學(xué)定性分析靶向代謝組學(xué)分...
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:多變量分析:多變量分析方法能同時(shí)處理數(shù)百或數(shù)千個(gè)變量,并且能處理變量之間的相互關(guān)系。利用變量之間的協(xié)方差或相關(guān)性,使原始數(shù)據(jù)在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數(shù)據(jù)中的信息。但是如果存在大量無(wú)信息變量可能會(huì)妨礙多變量分析的能力,無(wú)信息變量的數(shù)量越多,減少真陽(yáng)性數(shù)量的效果就越明顯。多變量分析分為無(wú)監(jiān)督分析方法和有監(jiān)督分析方法。在代謝組學(xué)分析中無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)有主成分分析只需要數(shù)據(jù)集X,而有監(jiān)督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析,這類方法在分析時(shí)除了需要數(shù)據(jù)集X,還需對(duì)樣品進(jìn)行指定并分組, 這樣分組后模型將自動(dòng)加上另外一個(gè)隱含的數(shù)據(jù)集Y,通常Y的...
代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。其研究對(duì)象大都是相對(duì)分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和**系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。 代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門學(xué)科,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分?;蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從基因和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動(dòng),而實(shí)際上細(xì)胞內(nèi)許多生命活動(dòng)是發(fā)生在代謝物層面的,如細(xì)胞信號(hào)釋放(cell signaling),能量...
藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對(duì)象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質(zhì),核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個(gè)龐大的混合物。目的是通過(guò)樣本的對(duì)比,發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,相當(dāng)具有靶向性,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測(cè)藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動(dòng)的效應(yīng)。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低。貴州植物靶向代謝組學(xué)分析方法代謝組學(xué)(英語(yǔ):metabolomics)是對(duì)細(xì)胞,生物流體,組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱...
什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是用來(lái)解決什么問(wèn)題的?代謝組學(xué)(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來(lái)的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過(guò)揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種病理生理過(guò)程中所發(fā)生的一系列生物事件。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先...
代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復(fù)凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進(jìn)行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請(qǐng)全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存,-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請(qǐng)咨詢譜領(lǐng)工作人員。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。武漢靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格代謝組學(xué)發(fā)展至今,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了標(biāo)準(zhǔn)臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種...
代謝組學(xué)發(fā)展前景:代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”,每年發(fā)表的代謝組學(xué)研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速,盡管還沒(méi)有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過(guò)市場(chǎng)研究發(fā)現(xiàn),健康人并不希望進(jìn)行基因型分析,所以,對(duì)于這些人群來(lái)說(shuō),基因組學(xué)研究在臨床上的應(yīng)用很有限。而代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似,且相對(duì)于基因組學(xué)來(lái)說(shuō),提供的個(gè)人信息更少,故其在臨床上的應(yīng)用有可能產(chǎn)生一定的影響。代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。江蘇GC-MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么...
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測(cè) (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測(cè) (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長(zhǎng)了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測(cè)的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對(duì)極為特定質(zhì)量的檢測(cè)。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對(duì)非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測(cè)和定量。代謝組學(xué)的研究對(duì)...
代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用: 代謝組學(xué)研究人員已經(jīng)對(duì)此進(jìn)行了研究。新生兒是否缺失酶基因,可以在出生時(shí)就檢測(cè)出來(lái)??蓹z測(cè)出包括涉及合成途徑中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的結(jié)果就是相應(yīng)的代謝產(chǎn)物過(guò)少或過(guò)多。尿癥(PKU)是一種常見(jiàn)的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因,導(dǎo)致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時(shí)檢測(cè)出這種天生的代謝缺乏,在嬰兒出生后九個(gè)月內(nèi),就會(huì)引起無(wú)法挽救的大腦損傷。這種疾病通過(guò)簡(jiǎn)單的血樣和尿素化驗(yàn)就可以確診。而血樣和尿素化驗(yàn)以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像尿癥那樣的疾病,研究人員正試圖從疾病的生物化學(xué)基礎(chǔ)著手,而不是只有檢測(cè)生物標(biāo)...
靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過(guò)對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開(kāi)發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說(shuō);進(jìn)行基于假說(shuō)的探索性實(shí)驗(yàn),針對(duì)特定代謝物,研究代謝模型。代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律。湖北LC-...
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用: 代謝組學(xué)研究人員已經(jīng)對(duì)此進(jìn)行了研究。新生兒是否缺失酶基因,可以在出生時(shí)就檢測(cè)出來(lái)??蓹z測(cè)出包括涉及合成途徑中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的結(jié)果就是相應(yīng)的代謝產(chǎn)物過(guò)少或過(guò)多。尿癥(PKU)是一種常見(jiàn)的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因,導(dǎo)致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時(shí)檢測(cè)出這種天生的代謝缺乏,在嬰兒出生后九個(gè)月內(nèi),就會(huì)引起無(wú)法挽救的大腦損傷。這種疾病通過(guò)簡(jiǎn)單的血樣和尿素化驗(yàn)就可以確診。而血樣和尿素化驗(yàn)以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像尿癥那樣的疾病,研究人員正試圖從疾病的生物化學(xué)基礎(chǔ)著手,而不是只有檢測(cè)生物標(biāo)...
代謝組學(xué)(英語(yǔ):metabolomics)是對(duì)細(xì)胞,生物流體,組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱為代謝物,metabolites)的大規(guī)模研究。 這些小分子及其在生物系統(tǒng)中的相互作用統(tǒng)稱為代謝組。能夠?qū)ι飿颖局械拇x物進(jìn)行全方面分析的一項(xiàng)新興技術(shù),被定義為代謝組學(xué)技術(shù)。代謝組學(xué)是在后基因組學(xué)時(shí)代興起的一門跨領(lǐng)域?qū)W科,其主要目標(biāo)是定量的研究生命體對(duì)外界刺激、病理生理變化、以及本身基因突變而產(chǎn)生的其體內(nèi)代謝物水平的多元?jiǎng)討B(tài)反應(yīng)。之后得到迅速發(fā)展并滲透到多項(xiàng)領(lǐng)域,比如疾病診斷、醫(yī)藥研制開(kāi)發(fā)、營(yíng)養(yǎng)食品科學(xué)、毒理學(xué)、環(huán)境學(xué),植物學(xué)等與人類健康護(hù)理密切相關(guān)的領(lǐng)域。代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)...
代謝組學(xué)發(fā)展至今,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了標(biāo)準(zhǔn)臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物。代謝組學(xué)提供了代謝表型的詳細(xì)表征,并可以在許多水平上進(jìn)行精密醫(yī)學(xué)研究,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標(biāo)以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測(cè)藥物的活性。比較常見(jiàn)的代謝組學(xué)分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為L(zhǎng)C-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場(chǎng)的作用,形成離子束,進(jìn)入質(zhì)量分析器。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。湖北常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域代謝組學(xué)樣本收集植物組織:果實(shí)、種子:1...
GC-MS非靶向代謝組學(xué)醫(yī)學(xué)分析生物樣本為何要衍生化處理?有哪些衍生化的方法?GC的流動(dòng)相為氣體(通常為高純氦),這就要求被分析物必須能夠氣化,而生物樣本中很多內(nèi)源性代謝物都含有極性基團(tuán),具有沸點(diǎn)高、不易氣化特點(diǎn)。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點(diǎn),增加它們的熱穩(wěn)定性,以便分析能夠順利進(jìn)行。衍生化方法及試劑種類繁多,根據(jù)不同的分析目標(biāo),需選擇合適的衍生化方法。如分析脂肪酸,我們可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代謝平臺(tái)上,比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因?yàn)樗膹V譜高效。在進(jìn)行硅烷化衍生之前,還需添加甲氧胺吡啶溶液,以封閉羰基(針對(duì)α-酮酸和糖類,保護(hù)作用),減少衍生化副產(chǎn)物的生成。代謝組學(xué)先進(jìn)分...
代謝組學(xué)細(xì)胞樣本收集:懸浮細(xì)胞:1)連同培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移到1.5 mL的進(jìn)口離心管中。2)低速離心5 min(低于3000 rpm),使細(xì)胞沉淀于離心管的底部(1*107個(gè)細(xì)胞為宜)。3)倒掉培養(yǎng)基(盡量倒干凈),用預(yù)冷的PBS反復(fù)沖洗2 ~ 3次,低速離心5 min,棄上清。4)標(biāo)記離心管,將離心管的尖的一端插入液氮中,淬滅細(xì)胞沉淀1 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。注意事項(xiàng):1. 培養(yǎng)基傾倒時(shí)盡量倒干凈,可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈;2. 甲醇/水請(qǐng)使用色譜純及以上規(guī)格;3. 液氮淬滅細(xì)胞時(shí),請(qǐng)小心避免離心管破碎導(dǎo)致樣本受損;4. 建議細(xì)胞樣本在進(jìn)行培養(yǎng)時(shí)多準(zhǔn)備樣本,以備后續(xù)使用。代謝組學(xué)作為系...