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代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時(shí),在中午光照好的時(shí)間收集。(2)采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學(xué)的代謝物的種類要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目。山東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)技術(shù)
靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說;進(jìn)行基于假說的探索性實(shí)驗(yàn),針對特定代謝物,研究代謝模型。四川個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)分析代謝組學(xué)可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。
代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎(chǔ)能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學(xué)本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對某一生物、組織或細(xì)胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性與定量分析的一門科學(xué)。代謝組學(xué)以指標(biāo)分析為基礎(chǔ),高通量檢測為手段,通過研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機(jī)體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學(xué)的分支學(xué)科之一。其研究內(nèi)容主要包括對代謝物進(jìn)行定性或定量分析,不同基因型的生物體進(jìn)行代謝組學(xué)表型研究,不同生長環(huán)境及加物理、化學(xué)或生物性刺激后個(gè)體代謝產(chǎn)物的應(yīng)答,進(jìn)行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡(luò)解析與轉(zhuǎn)基因評(píng)價(jià)。
代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過程。基因測序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因?yàn)榛虻恼{(diào)控和生物學(xué)事件之間隔了一個(gè)很漫長的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學(xué)發(fā)展進(jìn)入瓶頸;發(fā)展代謝組是因?yàn)榇x物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時(shí)在價(jià)格等方面更有推廣的意義。代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。
什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是用來解決什么問題的?代謝組學(xué)(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)是用來解決什么問題的?湖北動(dòng)物靶向代謝組學(xué)研究方法
代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢。山東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)技術(shù)
代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評(píng)價(jià)。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺(tái)的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達(dá)到fM級(jí)。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號(hào)響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個(gè)能檢測出來,另一個(gè)檢測不出來。山東個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)技術(shù)
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