RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：相比基因芯片和標(biāo)記的堿基序列的測序方法，RNA-seq具有一定的優(yōu)越性。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達(dá)水平情況，還可以揭示未知的轉(zhuǎn)錄組和拼接亞型，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針，即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進(jìn)行檢測，提供更精確的數(shù)字化信號、更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍，是目前深入研究復(fù)雜性轉(zhuǎn)錄組的強(qiáng)大工具。鑒于這些優(yōu)勢，RNA-Seq很快就被應(yīng)用到關(guān)于瘤病相關(guān)研究的多個方面。轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。杭州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)定性分析

RNA-Seq，是基于新一代測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的RNA并進(jìn)行mRNA富集，然后反轉(zhuǎn)錄為cDNA后進(jìn)行的新一代高通量測序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行片段的拼接組裝，從而可得到一個個的轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以形成對該生物樣品當(dāng)前發(fā)育狀態(tài)的基因表達(dá)狀況的全局了解。不同階段或部位的生物樣品的RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。轉(zhuǎn)錄組學(xué)即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。南京IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以對任意物種進(jìn)行全基因組分析。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究特定的細(xì)胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學(xué)科，轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法，研究特定的細(xì)胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達(dá)、結(jié)構(gòu)的差異，闡明分子機(jī)制。應(yīng)用領(lǐng)域：醫(yī)學(xué)研究：疾病標(biāo)志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復(fù)發(fā)診斷、病因與病理機(jī)制探究、臨床療效評價、藥物毒理學(xué)評價。生命科學(xué)研究：非生物環(huán)境關(guān)系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應(yīng)用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應(yīng)用。

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)成環(huán)機(jī)制：circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機(jī)制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上，通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點(diǎn)連接到上游的3′受體的位點(diǎn)，索尾插接形成環(huán)化，然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進(jìn)circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側(cè)的內(nèi)含子中含有反向互補(bǔ)序列，首先在剪切位點(diǎn)上并排形成RNA雙鏈體，再通過可變剪切形成帶內(nèi)含子和不帶內(nèi)含子兩種不同的circRNA?；蛘咄怙@子內(nèi)部以及兩側(cè)的內(nèi)含子可以競爭進(jìn)行RNA配對，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于不同的生長階段或者發(fā)育過程。

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：RNA-seq技術(shù)可以檢測到低水平表達(dá)、未識別的轉(zhuǎn)錄子和新拼接亞型基因。另一方面，與基因芯片相比，RNA-Seq有一個更廣的檢測動態(tài)范圍，可以研究編碼和非編碼RNA，更易于基因網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建、發(fā)現(xiàn)選擇性剪切轉(zhuǎn)錄物，檢測到等位基因的具體表達(dá)方式，也可以用來提取基因型信息。在RNA-Seq單細(xì)胞研究中，一個主要優(yōu)勢是可以分析整個轉(zhuǎn)錄序列，而不是有限制數(shù)量的基因，并且，研究DNA和RNA的方法并不是相互排斥的，他們可以相互結(jié)合使用，產(chǎn)生更多的生物學(xué)上重要的信息。轉(zhuǎn)錄組學(xué)狹義上指所有mRNA的組合。山東mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)分析

轉(zhuǎn)錄組具有時間特異性的特點(diǎn)。杭州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)定性分析

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