蛋白質(zhì)乙酰化修飾鑒定流程：1. 組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?；贵w對乙?；揎楇亩芜M行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?；亩芜M行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對鑒定的乙?；稽c的生物學功能進行解釋預測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展，我們越來越深刻地意識到，對于生物體生命活動的管理和調(diào)控過程，密切相關的不只是單個蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質(zhì)組學水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術和豐富的、準確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學成為現(xiàn)實，借助這些組學研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學服務

蛋白磷酸化檢測方法：一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢：1. WB方法簡便，多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏，能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白，可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集，再進行WB檢測被磷酸化的蛋白，檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法：Western Blot的方法雖然簡便，但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質(zhì)譜儀，如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠，或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白，將含有目標蛋白的條帶切下，胰酶消化，LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。廣州丙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學質(zhì)譜鑒定在眾多乙?；揎椀牡鞍踪|(zhì)中，研究較多的要數(shù)細胞核中包圍DNA的組蛋白了。

蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學技術：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩?，從而實現(xiàn)乙?；蔫b定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個以上可見考染條帶。2、溶液（目標蛋白質(zhì)）：目標蛋白總量>50μg，目標蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)模混合蛋白質(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。

蛋白質(zhì)學組翻譯后修飾的類型：翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學修飾和肽鍵的裂解，其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學修飾反應是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎上，通過基于其氨基酸殘基的化學反應獲得新的生物結(jié)合物。翻譯后修飾在哪里發(fā)生？翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端。現(xiàn)有的官能團或新官能團的引入可被用于修飾蛋白質(zhì)，以擴展20個標準氨基酸的化學組成。翻譯后修飾的位點通常帶有可以在化學反應中充當親核試劑的官能團，如絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基；賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式；同時，在蛋白質(zhì)的N端和C端，天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點的一些亞甲基上。蛋白質(zhì)修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙?；⒎核鼗?、丙酰化、丁?；?、丙二?；?。

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理：相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白，翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進入質(zhì)譜進行分析；通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個特定的肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的，當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后，例如磷酸化修飾，因為磷酸根的分子量也是確定的，所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量，則可以假設這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾，再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。廣州蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點：能夠特異鑒定單個磷酸化位點。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學服務

翻譯后修飾蛋白組學分析：在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進入質(zhì)譜進行分析。通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下，其序列信息和分子量是確定的。當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后，例如磷酸化修飾，由于序列信息和分子量是確定的，磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量，假設這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾，再通過二級質(zhì)譜圖進行二次確認。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學服務

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