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代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有:臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個(gè)或多個(gè)瞬時(shí)狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡(jiǎn)單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動(dòng)。另外,不同的檢測(cè)要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請(qǐng)參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于藥物毒理學(xué)。脂質(zhì)代謝組學(xué)多質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō),不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō),質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。哈爾濱脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。
代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運(yùn)用代謝組學(xué)檢測(cè)腸菌代謝物的動(dòng)態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對(duì)生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞乃至機(jī)體的生理、病理過程之間的關(guān)系,普遍運(yùn)用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。
代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等)合作,做過植物,微生物提取物,腦脊液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,胎盤,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測(cè)出多少物質(zhì)?同的質(zhì)譜平臺(tái)靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺(tái)之間具有互補(bǔ)性。一般來(lái)說(shuō)GC/MS檢測(cè)血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,檢測(cè)尿液樣品定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個(gè)數(shù)量級(jí)。如果采用全二維GC/MS,物質(zhì)的數(shù)量要更多,可達(dá)1千以上。LC/MS檢測(cè)物質(zhì)的數(shù)量要遠(yuǎn)比GC/MS多,但能準(zhǔn)確定性和定量的不多,視不同的平臺(tái)(TQ、QTOF等)能達(dá)到幾十至2-3百個(gè)物質(zhì)。選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢(shì)有哪些?
代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。其樣品主要是動(dòng)植物的細(xì)胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR),質(zhì)譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測(cè)一系列樣品的NMR 譜圖,再結(jié)合模式識(shí)別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker)。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速。四川非靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析
相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì)?脂質(zhì)代謝組學(xué)多質(zhì)譜鑒定
如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),有以下幾個(gè)方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此,一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備,以減少人為的誤差。2)檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前,先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè),確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3)后期數(shù)據(jù)矯正,特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個(gè)樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時(shí),使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對(duì)整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正。脂質(zhì)代謝組學(xué)多質(zhì)譜鑒定
上海拜譜生物科技有限公司位于東川路555號(hào)丙樓1171室。公司自成立以來(lái),以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié),公司旗下多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測(cè),蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)深受客戶的喜愛。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠(chéng)信為本的理念,打造商務(wù)服務(wù)良好品牌。拜譜生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。