circRNA轉(zhuǎn)錄組學成環(huán)機制：circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為：依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上，通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點，索尾插接形成環(huán)化，然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側(cè)的內(nèi)含子中含有反向互補序列，首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體，再通過可變剪切形成帶內(nèi)含子和不帶內(nèi)含子兩種不同的circRNA。或者外顯子內(nèi)部以及兩側(cè)的內(nèi)含子可以競爭進行RNA配對，然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。轉(zhuǎn)錄組學可應用于基因點突變及多態(tài)性檢測。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領域

轉(zhuǎn)錄組學：轉(zhuǎn)錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學科，轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法，研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA，用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達、結(jié)構(gòu)的差異，闡明分子機制。應用領域：醫(yī)學研究：疾病標志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復發(fā)診斷、病因與病理機制探究、臨床療效評價、藥物毒理學評價。生命科學研究：非生物環(huán)境關系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應用。湖北mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組學方法轉(zhuǎn)錄組學可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本單核苷酸分辨率的準確度。

普通轉(zhuǎn)錄組學測序適用于哪些情況？普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類：一是不同的生長階段或者發(fā)育過程；二是不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉(zhuǎn)錄組學測序必須做生物學重復么？需要幾個重復？生物學重復是生物實驗所必須的，轉(zhuǎn)錄組測序也不例外，至少3次生物學重復。準備生物重復樣品時，通過對實驗的預先設計和控制，盡可能將與實驗處理無關的背景條件控制在同一水平，減少批次效應對結(jié)果的影響。轉(zhuǎn)錄組學測序可以同時測到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么？我們通常所講的轉(zhuǎn)錄組測序只能測到mRNA。但是全轉(zhuǎn)錄組測序通過構(gòu)建兩個測序文庫（一是小RNA測序文庫、二是lncRNA測序文庫）是可以測到以上4種RNA的。

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標志基因、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本，并進行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構(gòu)建文庫、上機測序再到結(jié)果解析既可以自己完成，又可以在專業(yè)公司進行。概括來看轉(zhuǎn)錄組的分析流程比較簡單，序列比對-轉(zhuǎn)錄本拼接(可選)-表達定量-差異基因-功能富集-定制分析。整個環(huán)節(jié)清晰流暢，可以作為剛開始接觸高通量測序?qū)W習比較合適的技術(shù)之一。轉(zhuǎn)錄組具有組織特異性的特點。

轉(zhuǎn)錄組學應用于胃腸瘤轉(zhuǎn)移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能，如細胞增殖、細胞周期、侵襲和轉(zhuǎn)移等。近年來研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結(jié)合蛋白參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡、增殖、細胞轉(zhuǎn)運，以及介導瘤耐藥的細胞內(nèi)酶，進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。有研究證實通過干擾環(huán)狀RNA的表達，可以提高瘤對藥物的敏感性，提示環(huán)狀RNA可能為抗瘤藥物耐藥性的研究提供新的靶點。普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領域

什么是轉(zhuǎn)錄組學測序？哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領域

轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學（transcriptomics），是一門在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科。簡而言之，轉(zhuǎn)錄組學是從RNA水平研究基因表達的情況。轉(zhuǎn)錄組即一個活細胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，是研究細胞表型和功能的一個重要手段。優(yōu)勢：高通量、更精確的數(shù)字信號；在單核苷酸水平對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測；分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達水平的同時，還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本；準確地識別可變剪切和融合基因。應用方向：植物生長機制的發(fā)現(xiàn)及干預；炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預；表達差異的研究；基因點突變及多態(tài)性檢測。哈爾濱宏轉(zhuǎn)錄學組領域

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