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廣東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)有哪些

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-23

蛋白磷酸化檢測(cè)方法:質(zhì)譜檢測(cè)方法優(yōu)勢(shì):1. 準(zhǔn)確度高,能夠同時(shí)檢測(cè)多個(gè)蛋白的多個(gè)磷酸化位點(diǎn)。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實(shí)際應(yīng)用中,Western Blot與質(zhì)譜分析方法各有各的好,誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測(cè)定磷酸化修飾的時(shí)候還應(yīng)該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體,那么lucky you,你可以選擇Western Blot進(jìn)行快速磷酸化測(cè)定研究。但是如果你所研究的蛋白質(zhì)沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體,或是抗體價(jià)效過低,亦或是需要大規(guī)模地檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)磷酸化蛋白的水平的話,質(zhì)譜檢測(cè)會(huì)是更好地選擇。乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。廣東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)有哪些

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù):技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn)。1、 檢測(cè)特異性高。2、能夠特異鑒定單個(gè)磷酸化位點(diǎn)。同位素標(biāo)記(Isotope Labeled)結(jié)合免疫印跡法:此方法的原理是當(dāng)?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時(shí),放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過免疫印跡方法檢測(cè)同位素標(biāo)記,從而達(dá)到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn):1、檢測(cè)技術(shù)靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應(yīng)結(jié)果檢測(cè)。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時(shí)分析多個(gè)蛋白磷酸化。貴陽蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)在眾多乙酰化修飾的蛋白質(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn):1、全方面性:磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)以整個(gè)細(xì)胞蛋白為研究對(duì)象,研究?jī)?nèi)容包括了細(xì)胞內(nèi)具有生命功能的蛋白,如細(xì)胞增生、細(xì)胞分裂和細(xì)胞分化等相關(guān)蛋白,因而研究更為全方面。2、可靠性:傳統(tǒng)的生物學(xué)研究蛋白質(zhì)磷酸化往往針對(duì)特定條件,以兩個(gè)蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發(fā)點(diǎn),具有局限性,缺乏整體認(rèn)識(shí)。磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)則可檢測(cè)不同蛋白激酶及磷酸化酶對(duì)同一個(gè)蛋白磷酸化程度的影響,因而結(jié)果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)反映的是細(xì)胞內(nèi)真實(shí)發(fā)生的事件,在一次試驗(yàn)中考慮了不同變量,克服了生物學(xué)中逐步添加變量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)以細(xì)胞內(nèi)蛋白為研究對(duì)象,相對(duì)于傳統(tǒng)的生物學(xué)研究以及蛋白質(zhì)芯片,更易發(fā)現(xiàn)未知的新磷酸化位點(diǎn)和磷酸化蛋白質(zhì)。如果可以聯(lián)合生物學(xué)技術(shù),則可以發(fā)現(xiàn)具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合,調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過實(shí)驗(yàn)的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點(diǎn)需要耗費(fèi)大量的資金和時(shí)間,并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實(shí)現(xiàn)。而計(jì)算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點(diǎn)。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括泛素化。

翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)方法:翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)技術(shù)包括有免疫沉淀、western blot、質(zhì)譜技術(shù)、體外生化分析等。其中,免疫沉淀是大多數(shù)翻譯后修飾檢測(cè)中的關(guān)鍵步驟,它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來富集目標(biāo)蛋白,之后再用western blot或質(zhì)譜技術(shù)分析目標(biāo)蛋白。Western blot和質(zhì)譜技術(shù)均可用于蛋白質(zhì)翻譯后修飾的下游檢測(cè),其中Western blot相對(duì)簡(jiǎn)單但依賴于特異性抗體且無法識(shí)別單個(gè)蛋白質(zhì)變化,質(zhì)譜則可以檢測(cè)包括未知PTM在內(nèi)的幾乎所有的PTMs但成本更高需要專業(yè)知識(shí)來分析產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)。研究人員可以根據(jù)成本、有無可用抗體,以及有沒有目標(biāo)等選擇合適的方法進(jìn)行檢測(cè)。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。南京蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)服務(wù)

常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化。廣東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)有哪些

質(zhì)譜分析乙?;鞍踪|(zhì)組:質(zhì)譜分析技術(shù)可以對(duì)蛋白質(zhì)組中的乙?;鞍走M(jìn)行鑒定、乙?;稽c(diǎn)定位以及定量。當(dāng)質(zhì)譜用于乙?;康鞍捉M研究中時(shí),因?yàn)橐阴;鞍踪|(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣,需要先對(duì)乙?;亩芜M(jìn)行富集,然后再對(duì)富集得到的乙酰化肽段樣品進(jìn)行定量分析。質(zhì)譜定量乙酰化蛋白組采用肽段預(yù)分離降低高豐度蛋白的影響,結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩?,從而實(shí)現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。為了鑒定和定量更多的乙?;亩?,在酶切過程中還可使用多種不同的酶對(duì)蛋白樣品進(jìn)行酶切。廣東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)有哪些

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