泛素化修飾蛋白質(zhì)組學技術(shù)原理：盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展，但是由于蛋白翻譯后修飾化學計量值低、復雜性大，直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物，組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此，很多翻譯后修飾的富集方法會被采用，來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例，從而提高了質(zhì)譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產(chǎn)生diGly位點。基于這一特異性，利用針對蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體，在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段，利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進行定量分析，能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關信號通路關鍵節(jié)點蛋白修飾的變化，滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。湖北琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組學領域

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學：是植物體內(nèi)比較常見的PTM修飾手段。它是指通過蛋白激酶和磷酸酶的作用在特定絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基上添加或去除一個或多個磷酸基團，進而有效地改變底物蛋白的結(jié)構(gòu)和活性。在植物體內(nèi)主要參與植物溫度脅迫、鹽脅迫、干旱脅迫、養(yǎng)分脅迫調(diào)控等大多數(shù)代謝和生理途徑。蛋白質(zhì)磷酸化對于許多生物現(xiàn)象的引發(fā)是很必要的，包括細胞生長、增殖、泛素（ubiquitin）介導的蛋白降解等過程。特別是酪氨酸磷酸化，作為細胞信號轉(zhuǎn)導和酶活性調(diào)控的一種主要方式，通常通過引發(fā)蛋白質(zhì)之間的相互作用，進而介導生長因子和細胞因子等對細胞膜上受體的信號調(diào)控。湖北琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組學領域糖基化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關鍵作用。

泛素化修飾PRM定量驗證：原理： 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化，在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG)，利用對泛素化賴氨酸（K-GG）具有高親和力的基序抗體，特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段，結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法，實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。

琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組鑒定：蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾是新近發(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾，是在琥珀酰輔酶 A 的介導下將一個負電荷四碳琥珀?；D(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程。賴氨酸琥珀?；谡婧思毎霸思毎衅毡榇嬖?，參與調(diào)控包括三羧酸循環(huán)，氨基酸代謝以及脂肪酸代謝在內(nèi)的多個代謝信號通路。琥珀?；鞍踪|(zhì)組以組織、細胞等較為復雜樣本為研究對象，目的在于鑒定樣品中發(fā)生琥珀酰化修飾的蛋白質(zhì)以及相應的琥珀?；揎椢稽c。琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點：采用主流抗體親和富集方法，特異性高，富集效率好。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在許多細胞過程中起著關鍵作用。

乙?；揎椀鞍捉M學應用方向：1、乙?；揎椗c細胞基因表達調(diào)控、表觀調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、信號轉(zhuǎn)導、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙?；鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機理研究。乙?；飳W意義：1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用；2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk；3、調(diào)節(jié)酶活性；4、調(diào)控蛋白亞細胞定位。生物領域各個研究方面，如：1、農(nóng)林領域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等；2、 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等。蛋白質(zhì)磷酸化修飾可應用于食品工業(yè)方面。濟南蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學費用

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學對于蛋白質(zhì)修飾位點的發(fā)現(xiàn)及研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。湖北琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組學領域

蛋白質(zhì)翻譯后修飾自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機聯(lián)用，對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進行，但是由于估計適當?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題，需要對結(jié)果進行過濾。自上而下分析策略：自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進行片段化，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。湖北琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組學領域