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南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學一般流程

來源: 發(fā)布時間:2022-05-15

泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術原理:首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進行分析定量。技術優(yōu)勢:1、高特異性的修飾類泛抗體;2、高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;應用領域:泛素化修飾還參與了細胞周期、增殖、細胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化心血管等疾病的發(fā)病密切相關。因此,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾種類有20多種。南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學一般流程

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當7個賴氨酸殘基的泛素與另一個泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價結合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,這是細胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細胞分裂,自噬,DNA修復,免疫應答,細胞消亡等方面同樣起到關鍵作用。與消化道內(nèi)進行的蛋白質(zhì)水解不同,從泛素與蛋白的結合到將蛋白水解成小的肽段,整個水解過程需要能量參與。人們開始意識到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個對于真核細胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。四川磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學分析研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學有什么重要的作用呢?

泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段,結合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾自中而下分析策略:自中而下的蛋白質(zhì)組學技術可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉(zhuǎn)移解離(ETD)的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機聯(lián)用,對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進行,但是由于估計適當?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結果進行過濾。自上而下分析策略:自上而下的技術可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進行片段化,不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。蛋白質(zhì)翻譯后修飾發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學產(chǎn)品:常規(guī)的蛋白質(zhì)組學研究往往只關注不同生理、病理條件下蛋白質(zhì)表達水平的變化。然而,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),許多重要的生命活動、疾病發(fā)生不僅與蛋白質(zhì)的豐度相關,更重要的是被各類蛋白質(zhì)翻譯后修飾所調(diào)控。因此深入研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾對揭示生命活動的機理、篩選疾病的臨床標志物、鑒定藥物靶點等方面都具有重要意義。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進行富集以提高其豐度。翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。四川磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學分析研究

乙?;揎椀鞍捉M學應用方向有什么?南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學一般流程

泛素化修飾蛋白組學研究:泛素化修飾蛋白組學是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進行富集以提高其豐度,然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對富集得到的泛素化肽段樣品進行定量分析。南京蛋白質(zhì)泛素化修飾組學一般流程