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代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時(shí),在中午光照好的時(shí)間收集。(2)采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營(yíng)養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜(HPLC,GC)。武漢GC-MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說(shuō)就是你有沒(méi)有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因?yàn)榇x物大多數(shù)都不是高沸點(diǎn)的,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點(diǎn)物質(zhì)難以檢測(cè)的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,一方面是NMR這個(gè)東西入行起點(diǎn)有點(diǎn)高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡(jiǎn)單,無(wú)損。不需要各種衍生化。而且NMR對(duì)于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對(duì)定性非常有用,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。河南代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。
代謝組學(xué)研究方法: 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō),不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō),質(zhì)譜(MS)并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補(bǔ)色譜的不足。過(guò)去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。
非靶向代謝組學(xué):新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),特別是人體的代謝網(wǎng)絡(luò),一直被認(rèn)為是相對(duì)復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)?,F(xiàn)在多數(shù)信號(hào)通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個(gè)很小的領(lǐng)域?;蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)研究已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對(duì)象,無(wú)疑是困難的。非靶向代謝組學(xué)又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),主要是將對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進(jìn)行比對(duì),以找出其代謝物的差異。代謝組學(xué)研究通過(guò)一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來(lái),提供一個(gè)“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物。然后通過(guò)已知的代謝通路逆推找出調(diào)節(jié)酶和基因,完成疾病發(fā)病機(jī)制、藥物療理機(jī)制等方面的研究。代謝組學(xué)先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和專家系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。
代謝組學(xué)檢測(cè)的手段有哪些?主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR ),液-質(zhì)聯(lián)用(LC-MS),氣-質(zhì)聯(lián)用(GC-MS),色譜(HPLC,GC)等。通過(guò)檢測(cè)一系列樣品的譜圖,再結(jié)合化學(xué)模式識(shí)別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),基因的功能,藥物的毒性和藥效等,并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker)。代謝組學(xué)可以檢測(cè)哪些樣品?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。其樣品主要是尿液,血漿或血清,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也做過(guò)植物,微生物提取物,腦脊液昆蟲(chóng)血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于藥物毒理學(xué)。上海動(dòng)物靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。武漢GC-MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
非靶向代謝組學(xué):非靶向代謝組學(xué)是將生物體所有內(nèi)源性代謝物作為研究目標(biāo)(廣篩),重點(diǎn)在于比較實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組,發(fā)現(xiàn)尋找其種具有明顯的變化的代謝物質(zhì)(差異代謝物),并構(gòu)建代謝通路以解釋代謝物于該生命體的關(guān)聯(lián)。LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢(shì):1、分析范圍廣,MS幾乎可以檢測(cè)所有的化合物,更加容易地解決了分析熱不穩(wěn)定化合物的難題;2、分離能力強(qiáng),即使被分析混合物在色譜上沒(méi)有完全分離開(kāi),但通過(guò)MS的特征離子質(zhì)量色譜圖也能分別給出它們各自的色譜圖來(lái)進(jìn)行定性定量。武漢GC-MS非靶向代謝組學(xué)檢測(cè)價(jià)格