代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運用代謝組學(xué)檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對生物體、組織或細胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關(guān)系,普遍運用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。代謝組學(xué)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。山東植物靶向代謝組學(xué)服務(wù)
如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實驗設(shè)計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應(yīng)當只由一個人負責(zé)前處理。推薦使用自動衍生設(shè)備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標作為儀器質(zhì)控。在每一個項目開始之前,先進行質(zhì)控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3)后期數(shù)據(jù)矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時,使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進行矯正。山東個性化定制靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”。
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時,在中午光照好的時間收集。(2)采集樣本時保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢。
代謝組學(xué)發(fā)展至今,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠遠超出了標準臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物。代謝組學(xué)提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學(xué)研究,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學(xué)分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場的作用,形成離子束,進入質(zhì)量分析器。在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標志物也是一個熱點領(lǐng)域。山東靶向代謝組學(xué)費用
代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。山東植物靶向代謝組學(xué)服務(wù)
代謝組學(xué)樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。山東植物靶向代謝組學(xué)服務(wù)