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山東蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-02

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要性:翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。例如,許多蛋白質(zhì)在翻譯完成后不久就被修飾,以介導(dǎo)適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)折疊或穩(wěn)定,或?qū)⑿律鞍踪|(zhì)引導(dǎo)到不同的細(xì)胞區(qū)室(例如,細(xì)胞核、膜)。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾,以刺激或滅活催化活性或以其他方式影響蛋白質(zhì)的生物活性。蛋白質(zhì)也與靶向降解蛋白質(zhì)的標(biāo)簽共價(jià)連接。除了單一的修飾外,蛋白質(zhì)通常還通過(guò)翻譯后切割和通過(guò)蛋白質(zhì)成熟的分步機(jī)制增加功能基團(tuán)的組合進(jìn)行修飾。分析蛋白質(zhì)及其翻譯后修飾對(duì)于心臟病、神經(jīng)退行性疾病和糖尿病的研究尤為重要。PTMs 的特征,雖然具有挑戰(zhàn)性,但提供了對(duì)病因?qū)W過(guò)程下的細(xì)胞功能的無(wú)價(jià)的洞察。在技術(shù)上,研究翻譯后修飾蛋白的主要挑戰(zhàn)是開(kāi)發(fā)特異性的檢測(cè)和純化方法。幸運(yùn)的是,這些技術(shù)障礙正在用各種新的和精煉的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)來(lái)克服。乙酰化修飾對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。山東蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)分析

乙?;揎椀鞍捉M學(xué)應(yīng)用方向:1、乙酰化修飾與細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控、表觀(guān)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過(guò)程研究。2、乙?;鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機(jī)理研究。乙?;飳W(xué)意義:1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調(diào)節(jié)酶活性;4、調(diào)控蛋白亞細(xì)胞定位。生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,如:1、農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;2、 畜牧業(yè):肉類(lèi)及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等。上海甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。

蛋白質(zhì)的甲基化修飾 :蛋白質(zhì)的甲基化(methylation)是指將甲基酶促轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)的某個(gè)殘基上,通常是賴(lài)氨酸或精氨酸,也包括組氨酸、半胱氨酸和天冬酰胺等。蛋白質(zhì)的甲基化是一種普遍的修飾,在大鼠肝細(xì)胞核的總蛋白提取物中,大約2%的精氨酸殘基是二甲基化的。蛋白質(zhì)甲基化經(jīng)常與乙?;⒘?,因?yàn)樗鼈兌际浅R?jiàn)的表觀(guān)遺傳修飾,經(jīng)常發(fā)生在組蛋白上。不過(guò)從化學(xué)反應(yīng)的角度來(lái)看,乙?;梢运阕饕环N短鏈脂?;揎?,這里主要討論甲基化方面的問(wèn)題。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)原理:首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對(duì)酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度,然后通過(guò)高質(zhì)量的泛素化修飾類(lèi)抗體和生物材料對(duì)修飾肽段進(jìn)行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、高特異性的修飾類(lèi)泛抗體;2、高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;應(yīng)用領(lǐng)域:泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖、細(xì)胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。泛素化心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來(lái)生物化學(xué)研究的一個(gè)重大成果,它已然成為研究、開(kāi)發(fā)新藥物的新靶點(diǎn)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點(diǎn):能夠特異鑒定單個(gè)磷酸化位點(diǎn)。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)樣品要求:1、動(dòng)物組織的樣品量濕重不少于200mg。2、植物細(xì)菌、噬菌體等微生物類(lèi)樣品量濕重不少于2g。3、富含雜質(zhì)或蛋白質(zhì)含量低的樣品量濕重不少于5g;如植物的根,木質(zhì)部、韌皮部組織等。4、體液類(lèi)(唾液、羊水、腦脊液等)10mL以上,要保證不能溶血;血清要求500μl以上;尿液要求50mL以上。5、如直接提供蛋白質(zhì)提取物,濃度不少于2 mg/mL,總量不少于1 mg。為保證實(shí)驗(yàn)效果,請(qǐng)盡量告知緩沖液成分,如是否有硫脲、SDS、強(qiáng)離子鹽等等。另樣品中應(yīng)不含核酸、脂類(lèi)、多糖等影響分離效果的成分。6、在細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)方面,提取細(xì)胞器或亞細(xì)胞器后,蛋白沉淀量在1 mg以上。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學(xué)主要技術(shù)

泛素化修飾蛋白質(zhì)組可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。山東蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)分析

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):是植物體內(nèi)比較常見(jiàn)的PTM修飾手段。它是指通過(guò)蛋白激酶和磷酸酶的作用在特定絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基上添加或去除一個(gè)或多個(gè)磷酸基團(tuán),進(jìn)而有效地改變底物蛋白的結(jié)構(gòu)和活性。在植物體內(nèi)主要參與植物溫度脅迫、鹽脅迫、干旱脅迫、養(yǎng)分脅迫調(diào)控等大多數(shù)代謝和生理途徑。蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)于許多生物現(xiàn)象的引發(fā)是很必要的,包括細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、泛素(ubiquitin)介導(dǎo)的蛋白降解等過(guò)程。特別是酪氨酸磷酸化,作為細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和酶活性調(diào)控的一種主要方式,通常通過(guò)引發(fā)蛋白質(zhì)之間的相互作用,進(jìn)而介導(dǎo)生長(zhǎng)因子和細(xì)胞因子等對(duì)細(xì)胞膜上受體的信號(hào)調(diào)控。山東蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)分析