蛋白質(zhì)組學概念：蛋白質(zhì)組學（英語：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學），是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組（Proteome）一詞，源于蛋白質(zhì)（protein）與基因組（genome）兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關于疾病發(fā)生，細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。蛋白質(zhì)組與基因組相對應，也是一個整體的概念。南京定量乙?；鞍踪|(zhì)組學價格
PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學分析流程是怎樣的？要做PRM首先要明確目標蛋白（或多肽）是什么，設計和建立針對這些目標蛋白PRM質(zhì)譜采集方法，然后對待測樣品進行PRM數(shù)據(jù)采集，將得到的原始譜圖數(shù)據(jù)導入分析軟件提取子離子信息進行定量。另外，如果配制已知濃度的標準肽段，用PRM額外做一個標準曲線，即可實現(xiàn)一定的定量。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學技術能應用到哪些方面？研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過PRM技術來實現(xiàn)。具體說來，比如驗證定量蛋白質(zhì)組學中某些蛋白的變化，多肽的相對和一定的定量，想做蛋白定量卻沒有抗體，針對蛋白修飾位點的定量，想同時定量多個蛋白的情況等，都可以用PRM來做。江蘇定量蛋白組學蛋白質(zhì)組學研究策略有什么？
定量蛋白質(zhì)組學分析：特點：（1）不同樣本標記之后混樣，統(tǒng)一處理上機，減少了分別上機造成的實驗誤差，并利用同位素標簽的豐度來檢測，定量更準確，重復性更好；（2）由于需要標記試劑標記，因此成本相對較高；（3）通量高，在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品；（4）利用基于同一個參考樣品的辦法，可以進行多于8個樣品的定量比較；（5）iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學分析：Label-Free定量，即非標記的定量蛋白質(zhì)組學，不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。
蛋白質(zhì)組學在農(nóng)業(yè)生物科研領域的應用：蛋白質(zhì)組學技術在農(nóng)業(yè)生物科研領域的應用為作物生長發(fā)育、病蟲害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用，為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開辟新途徑。蛋白質(zhì)組學在農(nóng)作物研究中的應用：農(nóng)業(yè)是我國人口賴以生存的基礎，而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關鍵。蛋白質(zhì)組學關鍵技術在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應答等關鍵環(huán)節(jié)的應用，為農(nóng)業(yè)作物的進一步開發(fā)利用提供巨大的參考價值。蛋白質(zhì)組學可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達變化，有助于作物發(fā)育過程機制的理解。蛋白質(zhì)組學現(xiàn)已被普遍應用于生命科學研究領域。
蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質(zhì)定性，或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當中；第2，蛋白質(zhì)定量，也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質(zhì)翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙?；鹊龋舶▽@些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規(guī)模，既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量，也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量。研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達量與實際對應蛋白質(zhì)的含量相關性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質(zhì)的定量相關性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高，經(jīng)過平均后r值只為0.4。蛋白質(zhì)組學對理解細胞生長、分化、代謝、衰老與病變有著重要作用。江蘇定量蛋白組學
蛋白質(zhì)組研究技術在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。南京定量乙?；鞍踪|(zhì)組學價格
常規(guī)蛋白質(zhì)組學：Labelfree多肽組學：顧名思義，就是不使用任何標記方法，直接對肽段進行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單，只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數(shù)（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學：TMT全稱是TandemMassTag，是經(jīng)典化學標記試劑，普遍用于差異表達蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術采用6重、10重或16重同位素標簽，與肽段的氨基發(fā)生共價結(jié)合反應，可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。（目前16標鹿明生物可提供技術服務）。南京定量乙?；鞍踪|(zhì)組學價格