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貴陽定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-10

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)原理:PRM技術(shù)是一種根據(jù)已知實(shí)測(cè)信息或質(zhì)譜檢測(cè)規(guī)律的假定信息對(duì)樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行靶向定量的技術(shù)。該技術(shù)主要應(yīng)用儀器為Q Exactive系列質(zhì)譜儀,首先以四極桿作為質(zhì)量過濾器,特異性地選擇與預(yù)先設(shè)定質(zhì)荷比相同的肽段離子(母離子)通過,隨后在高能碰撞池中碎裂母離子,之后通過Orbitrap分析碎片離子(子離子)得到肽段的二級(jí)質(zhì)譜信息。四極桿的高選擇性離子過濾與Orbitrap高分辨率測(cè)量技術(shù)的結(jié)合使得PRM技術(shù)有很高的特異性,并且有效的降低了背景噪音,去除了干擾離子,提高了靈敏度。在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。貴陽定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用為作物生長(zhǎng)發(fā)育、病蟲害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學(xué)疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開辟新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)作物研究中的應(yīng)用:農(nóng)業(yè)是我國(guó)人口賴以生存的基礎(chǔ),而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵。蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應(yīng)答等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的應(yīng)用,為農(nóng)業(yè)作物的進(jìn)一步開發(fā)利用提供巨大的參考價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個(gè)發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)變化,有助于作物發(fā)育過程機(jī)制的理解。武漢高通量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究蛋白質(zhì)組研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律。

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué),包括對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對(duì)尋找疾病的診斷標(biāo)志、篩選藥物靶點(diǎn)、毒理學(xué)研究等有重要意義,也因此被普遍應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究。蛋白質(zhì)組學(xué)研究,總體可分為一下幾個(gè)步驟:(1)差異篩選(Discovery)(2)初步驗(yàn)證(Verification)(3)然后確診(Validation)?;谫|(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué):是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù),首先利用四級(jí)桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子,隨后在collisioncell中對(duì)母離子進(jìn)行碎裂,然后利用Orbitrap分析器在二級(jí)質(zhì)譜中檢測(cè)所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測(cè),即可對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行相對(duì)(一定)定量。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展,我認(rèn)為今后我們會(huì)更多地在現(xiàn)實(shí)生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細(xì)胞癥)、糖化血紅蛋白比例測(cè)定等。從測(cè)試體量估計(jì),應(yīng)該遠(yuǎn)小于1%的ELISA測(cè)試量。蛋白質(zhì)組學(xué)現(xiàn)已被普遍應(yīng)用于生命科學(xué)研究領(lǐng)域。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué):產(chǎn)品分類:a.相對(duì)定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢(shì):(1)無需抗體,可直接對(duì)樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析。(2)高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度,靶向檢測(cè)目標(biāo)蛋白對(duì)應(yīng)的多個(gè)unique肽段。(3)通量高,可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)幾十個(gè)蛋白的定量檢測(cè)。樣本要求:動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本100mg/sample,血清、血漿200μL/sample,細(xì)胞、微生物1×107cells/sample。應(yīng)用方向:驗(yàn)證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果;目標(biāo)蛋白相對(duì)定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究,針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng),也是一個(gè)整體的概念。浙江外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定

樣本測(cè)到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān),一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。貴陽定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據(jù)庫(kù)的建立。現(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本體聯(lián)合會(huì)(Gene Onotology Consortium)所建立的數(shù)據(jù)庫(kù)。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能、生物學(xué)途徑、細(xì)胞組分而給予定義,無物種相關(guān)性。是系統(tǒng)分析基因功能,它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來,旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學(xué)藍(lán)圖。旨在借助計(jì)算機(jī)全方面地展示細(xì)胞和生物所包含的生物學(xué)信息;根據(jù)基因組中的信息,用計(jì)算機(jī)計(jì)算或者預(yù)測(cè)出比較復(fù)雜的細(xì)胞中的通路或者生物的復(fù)雜行為。貴陽定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)