代謝組學(xué)發(fā)展至今,代謝組學(xué)技術(shù)已經(jīng)遠遠超出了標(biāo)準(zhǔn)臨床化學(xué)技術(shù)的范圍,能夠精確分析數(shù)百至數(shù)千種代謝物。代謝組學(xué)提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學(xué)研究,包括表征疾病基礎(chǔ)的代謝紊亂,發(fā)現(xiàn)新的治靶標(biāo)以及發(fā)現(xiàn)可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學(xué)分析方法是質(zhì)譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質(zhì)譜技術(shù)又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶電荷的離子,經(jīng)加速電場的作用,形成離子束,進入質(zhì)量分析器。代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?河南個性化定制靶向代謝組學(xué)分析價格
什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué),著重對于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,主要體現(xiàn)在以下幾點:(1) 基因與蛋白質(zhì)表達的微小變化會在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。深圳LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)分析研究非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)。
代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運用代謝組學(xué)檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對生物體、組織或細胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關(guān)系,普遍運用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。
靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理,得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包,用統(tǒng)計工具,如ANOVA,對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序?qū)颖具M行檢測,且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。
代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過程。基因測序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調(diào)控和生物學(xué)事件之間隔了一個很漫長的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學(xué)發(fā)展進入瓶頸;發(fā)展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時在價格等方面更有推廣的意義。在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點領(lǐng)域。河南個性化定制靶向代謝組學(xué)分析價格
靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。河南個性化定制靶向代謝組學(xué)分析價格
代謝組學(xué)樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。河南個性化定制靶向代謝組學(xué)分析價格
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