蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫(yī)學。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學、生物信息學等相關學科的發(fā)展,我認為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學相關的應用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細胞癥)、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計,應該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因,蛋白質(zhì)組學技術并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目,采用基于質(zhì)譜(或二維膠等手段)的蛋白質(zhì)組學有獨特的技術優(yōu)勢。另外,蛋白質(zhì)組學方法開發(fā)和驗證周期短,在中高級特殊應用(如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制)中也有其獨特優(yōu)勢。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”。深圳醫(yī)學蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)組學技術:等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時,其靜電荷數(shù)為零,在電場中不再移動,據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。上海新型修飾蛋白組學領域蛋白質(zhì)組學技術有生物質(zhì)譜。
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術):應用:1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數(shù)據(jù)。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術特點:1.對質(zhì)譜儀器設備要求較高,色譜和質(zhì)譜需要同時有較好的穩(wěn)定性和重復性。2.需要有特殊的定量分析軟件。3.對樣品中蛋白質(zhì)總量要求較低,實驗周期短,實驗費用低。4.不需要額外并且昂貴的標記試劑,排除了標記過程帶入實驗誤差的風險,同時也不必考慮標記效率的問題。
蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,那些世界范圍內(nèi)銷路比較好的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子。因此,蛋白質(zhì)組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。蛋白質(zhì)組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。質(zhì)譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。
蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢:技術發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術并存,各有優(yōu)勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強調(diào)各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外,蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術新方法的活水之源,特別是,蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)??茖W如基因組學,生物信息學等領域的交叉,構成組學(omics)生物技術研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(SystemBiology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。蛋白質(zhì)組與基因組相對應,也是一個整體的概念。Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學價格
蛋白質(zhì)組隨著基因組學研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學已逐漸成為研究熱點。深圳醫(yī)學蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術):在非標記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎,通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度;其二,以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎,通過歸一化來表征被檢測蛋白質(zhì)的相對豐度。非標記技術認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關,因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。深圳醫(yī)學蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析
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