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蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實(shí)驗(yàn)室具備Western Blot設(shè)備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標(biāo)蛋白的抗體對目標(biāo)蛋白進(jìn)行富集,再進(jìn)行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復(fù)雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準(zhǔn)確度質(zhì)譜儀,如今快速準(zhǔn)確分析細(xì)胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標(biāo)蛋白,將含有目標(biāo)蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應(yīng)位點(diǎn)的磷酸化修飾。這個(gè)方法適用于同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)分析
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價(jià)修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的所有過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的比較主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。湖北棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)錢乙?;揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾。
質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個(gè)特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因?yàn)榱姿岣姆肿恿恳彩谴_定的,所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個(gè)磷酸根的分子量,則可以假設(shè)這個(gè)肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)即可實(shí)現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點(diǎn)分析等。
蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎(chǔ)生物學(xué)以及疾病發(fā)病機(jī)理中的重要性,因此非常需要對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行檢測。對蛋白翻譯后修飾進(jìn)行研究時(shí)通常需要富集步驟,因?yàn)檫@些翻譯后修飾的蛋白質(zhì)相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結(jié)合在一起開發(fā),以提供比較好的機(jī)會來識別、驗(yàn)證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質(zhì)時(shí),可能不需要富集步驟。質(zhì)譜技術(shù),通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進(jìn)行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進(jìn)行定性和定量分析。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括泛素化。
蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點(diǎn)發(fā)生何種修飾。可檢測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙?;?、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀?;渭谆?、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長發(fā)育機(jī)理等;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等;3、乙酰化:基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等;5、甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;6、丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二?;?/ 琥珀酰化:主要存在于線粒體和細(xì)菌中,與代謝過程密切相關(guān)。蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程。哈爾濱蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)研究
蛋白質(zhì)磷酸化修飾怎么定義?深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)分析
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價(jià)修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。深圳蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)分析
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