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浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法

來源: 發(fā)布時間:2022-03-13

轉(zhuǎn)錄組是干什么用的,和表達(dá)譜有什么區(qū)別?轉(zhuǎn)錄組,指細(xì)胞某一時期所有基因的轉(zhuǎn)錄水平。轉(zhuǎn)錄組學(xué),是一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。簡而言之,轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達(dá)的情況。對RNA的分析。分析應(yīng)該是分幾個維度的DNA到RNA,RNA的剪切拼接,RNA的翻譯。表達(dá)譜有兩種,分別是基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)表達(dá)譜?;虮磉_(dá)譜是指細(xì)胞中所有基因表達(dá)的格局。通過比較分析基因表達(dá)譜,可從整體水平研究代謝機(jī)制,認(rèn)識基因相互作用的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)重要基因。轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法

全轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序技術(shù)優(yōu)勢:文庫優(yōu)化:針對不同長度的序列采用兩種文庫構(gòu)建方法,采用去核糖體的鏈特異性文庫可以獲得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。數(shù)據(jù)全:全轉(zhuǎn)錄組測序完成后可獲取4類主要RNA(miRNA,mRNA,lncRNA,circRNA)數(shù)據(jù),可對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)分析及整合分析。關(guān)聯(lián)全:通過對mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列測定及后續(xù)分析,深入開展全轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(ceRNA網(wǎng)絡(luò))分析。樣本類型:細(xì)胞,組織,體液、血清、血漿、全血,總RNA等。建議總RNA起始量:>15μg,濃度≥200ng/μL)。廣東外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要技術(shù)轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于表達(dá)差異的研究。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序具有以下優(yōu)勢:(1)可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度,同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測細(xì)胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;(3)可以對任意物種進(jìn)行全基因組分析,無需預(yù)先設(shè)計特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,同時能夠檢測未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,并準(zhǔn)確地識別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,UTR區(qū)域。(4)檢測范圍廣,高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù):Anydeplete技術(shù)首先通過隨機(jī)引物進(jìn)行一鏈合成,一鏈合成引入核苷酸類似物,用于酶切打斷,二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭,接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物,用于酶切降解。當(dāng)形成單鏈文庫后,設(shè)計特異性引物與rRNA形成文庫結(jié)合,一輪退火延伸,rRNA文庫形成雙鏈結(jié)構(gòu)。Reverseadaptor上帶有特異的酶切位點(diǎn),當(dāng)形成雙鏈結(jié)構(gòu)酶切位點(diǎn)被識別,切去接頭,這樣rRNA形成的文庫不帶有完整的接頭,而其他文庫帶有完整接頭,通過PCR擴(kuò)增富積既能得到想要的信息,包含mRNA及LncRNA信息。同樣Anydeplete技術(shù)與10×genomics技術(shù)一樣,包含分子標(biāo)簽,可分析duplication及PCR產(chǎn)生突變位點(diǎn)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長發(fā)育機(jī)制,抗逆脅迫機(jī)制,育種,物種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):生長發(fā)育機(jī)制,致病機(jī)理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;海洋水產(chǎn):生長發(fā)育機(jī)制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;微生物:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,藥物開發(fā),個性化醫(yī)治等;環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險評估研究等;食品科學(xué):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量、更精確的數(shù)字信號。廣東外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要技術(shù)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)廣義上指在某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法

商務(wù)服務(wù)的發(fā)展在一定程度上可以解決企業(yè)發(fā)展痛點(diǎn),能夠創(chuàng)造出良好的創(chuàng)業(yè)土壤,讓企業(yè)專注于重點(diǎn)主營業(yè)務(wù),剝離繁瑣的事務(wù)運(yùn)轉(zhuǎn)。商務(wù)服務(wù)也屬于共享經(jīng)濟(jì)的范疇,可以使企業(yè)共享資源和服務(wù),降低成本。文化賦予了銷售獨(dú)特的生命力和吸引力,從精神層面讓用戶產(chǎn)生深度的關(guān)聯(lián)。中華文明傳承五千年,很多文化自古有之,備受文人墨客的青睞。千百年后的人群依舊能因?yàn)橐皇自?,穿越到彼時,這就是文化的力量催生了人類“共情”的能力。在文創(chuàng)產(chǎn)品方面,服務(wù)型企業(yè)是蘊(yùn)含著傳統(tǒng)文化基因的禮物是文化服務(wù),是中國及世界精神文明的象征。所以對于行業(yè)內(nèi)的無數(shù)企業(yè)來說,這不僅是一個巨大商機(jī),更是一個發(fā)展前景。中國的有限責(zé)任公司(自然)的優(yōu)化處于發(fā)展的重要戰(zhàn)略機(jī)遇期,加強(qiáng)城市文化、商業(yè)的多樣化,促進(jìn)城市平衡發(fā)展,“無邊界”式融合,才能實(shí)現(xiàn)有限責(zé)任公司(自然)大發(fā)展,真正迎來可持續(xù)發(fā)展和推廣。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法

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