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貴陽泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-03-11

翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)方法:翻譯后修飾蛋白的檢測(cè)技術(shù)包括有免疫沉淀、western blot、質(zhì)譜技術(shù)、體外生化分析等。其中,免疫沉淀是大多數(shù)翻譯后修飾檢測(cè)中的關(guān)鍵步驟,它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來富集目標(biāo)蛋白,之后再用western blot或質(zhì)譜技術(shù)分析目標(biāo)蛋白。Western blot和質(zhì)譜技術(shù)均可用于蛋白質(zhì)翻譯后修飾的下游檢測(cè),其中Western blot相對(duì)簡(jiǎn)單但依賴于特異性抗體且無法識(shí)別單個(gè)蛋白質(zhì)變化,質(zhì)譜則可以檢測(cè)包括未知PTM在內(nèi)的幾乎所有的PTMs但成本更高需要專業(yè)知識(shí)來分析產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)。研究人員可以根據(jù)成本、有無可用抗體,以及有沒有目標(biāo)等選擇合適的方法進(jìn)行檢測(cè)。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。貴陽泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析

蛋白翻譯后修飾:蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價(jià)結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的一個(gè)步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質(zhì)產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙?;?、糖基化、泛素化和二硫鍵等等,它導(dǎo)致蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的大幅增加。對(duì)于任何給定的蛋白質(zhì),各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能來促進(jìn)細(xì)胞快速變化的方法。PTMs在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)率、蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)識(shí)別和相互作用以及空間定位中起著至關(guān)重要的作用。武漢丙二?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)服務(wù)蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有簡(jiǎn)單的特性。

蛋白翻譯后修飾檢測(cè):由于PTMs在基礎(chǔ)生物學(xué)以及疾病發(fā)病機(jī)理中的重要性,因此非常需要對(duì)蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)蛋白翻譯后修飾進(jìn)行研究時(shí)通常需要富集步驟,因?yàn)檫@些翻譯后修飾的蛋白質(zhì)相對(duì)含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測(cè)方法與富集策略結(jié)合在一起開發(fā),以提供比較好的機(jī)會(huì)來識(shí)別、驗(yàn)證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測(cè)已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質(zhì)時(shí),可能不需要富集步驟。質(zhì)譜技術(shù),通過測(cè)定肽段的分子量可以對(duì)該肽段的翻譯后修飾情況進(jìn)行檢測(cè),并可以對(duì)翻譯后修飾蛋白進(jìn)行定性和定量分析。

蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩?duì)乙酰化修飾的功能研究主要集中在對(duì)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對(duì)代謝通路的調(diào)控這兩個(gè)方面。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙?;5鞍踪|(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾:相對(duì)于蛋白質(zhì)印跡等技術(shù),質(zhì)譜技術(shù)能更有效的對(duì)蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進(jìn)行分析,且可以對(duì)常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進(jìn)行補(bǔ)充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識(shí)別目的蛋白的特定翻譯后修飾,因?yàn)橘|(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個(gè)肽段來鑒定的,這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識(shí)別的機(jī)會(huì)。一種提高質(zhì)譜儀檢測(cè)到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進(jìn)行肽段富集,而不是使用PTM親和試劑進(jìn)行蛋白富集,這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。通過蛋白質(zhì)翻譯后修飾也進(jìn)一步增加了細(xì)胞通路機(jī)制和生命活動(dòng)的多樣性和復(fù)雜性。武漢磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類型

蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學(xué)意義?貴陽泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析

翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會(huì)首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析。通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對(duì)于某一個(gè)特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,其序列信息和分子量是確定的。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,由于序列信息和分子量是確定的,磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測(cè)過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個(gè)磷酸根的分子量,假設(shè)這個(gè)肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級(jí)質(zhì)譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)。貴陽泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析

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