蛋白質磷酸化修飾組學技術:蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種普遍的調控手段。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調節(jié)著包括細胞的增殖、發(fā)育、分化、細胞骨架調控、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的過程,并且可逆的蛋白質磷酸化是目前所知道的主要的信號轉導方式。目前已經知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導致的后果。在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾。深圳蛋白質泛素化修飾組學有哪些
蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白,將含有目標蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。深圳蛋白質泛素化修飾組學有哪些蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。
蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化,將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的,去磷酸化反應由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法:Western Blot檢測方法:Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質,隨后將蛋白質轉移到PVDF膜上,然后使用特異性識別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會在相應分子質量的地方顯現特異性蛋白條帶。
蛋白質修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性,從而檢測蛋白質或者多肽上位點發(fā)生何種修飾??蓹z測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀?;?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質折疊、更新以及免疫應答等;3、乙?;夯虮磉_調控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質穩(wěn)定性以及神經退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA修復以及信號轉導等;5、甲基化:染色質結構及轉錄調控等;6、丙酰化 / 丙二?;?/ 戊二?;?/ 琥珀?;褐饕嬖谟诰€粒體和細菌中,與代謝過程密切相關。蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。
蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術對蛋白質的有效分辨率已達到229kDa,一次可以檢測到的蛋白質數量也在增加。蛋白質翻譯后修飾可以改變蛋白質的物理、化學性質。南京蛋白質糖基化修飾組學
蛋白質乙?;揎椊M學技術對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。深圳蛋白質泛素化修飾組學有哪些
蛋白質乙?;揎椊M學技術:乙?;揎検求w內保守的可逆轉的蛋白修飾,對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著重要的作用。此外,還存在的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調節(jié)。采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?;b定的影響,再結合免疫共沉淀通過抗體富集乙?;碾亩?,從而實現乙酰化的鑒定及定量。樣品要求:1、SDS-PAGE條帶:5個以上可見考染條帶。2、溶液(目標蛋白質):目標蛋白總量>50μg,目標蛋白濃度>80%。3、溶液(大規(guī)?;旌系鞍踪|):蛋白總量>1mg,蛋白濃度>1μg/μl。深圳蛋白質泛素化修飾組學有哪些
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