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哈爾濱植物靶向代謝組學定性分析

來源: 發(fā)布時間:2022-02-07

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與 正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學。哈爾濱植物靶向代謝組學定性分析

代謝組學的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據研究的對象和目的不同,科學家將生物體系的代謝產物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結構、性質相關的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內特定組織內的代謝產物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。北京GC-MS非靶向代謝組學服務代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。

選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些?代謝組學的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質和細胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產生和代謝是基因表達的下游產物,生物體液的代謝產物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少,大約在103個數量級,要遠小于基因和蛋白質的數據,物質的分子結構要簡單得多,分析起來更簡單明了。代謝組學的代謝物信息庫簡單,它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數據庫那么復雜?;蚝偷鞍踪|表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。代謝產物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。

代謝組學應用方向:腸道菌群代謝組學,運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關系,為疾病的預防,調高宿主的健康水平提供新的思路。經典脂質組學:對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質的結構和功能,揭示脂質代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關系,普遍運用于分子生理學、功能基因組學以及環(huán)境與健康等重要領域。與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。

靶向代謝組學分析成功的關鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),或在三重串聯四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應離子監(jiān)測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因為監(jiān)測的是一個很小的質量窗口,所以質量色譜圖只表示對極為特定質量的檢測。在大多數情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a生獨特的碎片離子,可對非常復雜基質中的目標化合物進行監(jiān)測和定量。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。廣州個性化定制靶向代謝組學鑒定

與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。哈爾濱植物靶向代謝組學定性分析

代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。哈爾濱植物靶向代謝組學定性分析

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